More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0158 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0158  PAS sensor protein  100 
 
 
170 aa  350  8e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00559927  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1233  methyl-accepting chemotaxis protein  69.14 
 
 
166 aa  248  3e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1962  methyl-accepting chemotaxis protein  70.55 
 
 
166 aa  247  6e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1012  methyl-accepting chemotaxis protein  53.75 
 
 
171 aa  202  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63093  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0044  putative PAS/PAC sensor protein  58.17 
 
 
162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05500  PAS domain S-box  45.68 
 
 
194 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.414164  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0920  putative PAS/PAC sensor protein  48.75 
 
 
170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0368  PAS sensor protein  47.5 
 
 
168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4662  putative PAS/PAC sensor protein  46.63 
 
 
168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.193201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1393  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.01 
 
 
182 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2378  transcriptional regulator  46.47 
 
 
174 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1223  signal-transduction sensor protein  45.83 
 
 
189 aa  159  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.658782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4009  PAS  45.06 
 
 
172 aa  157  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1071  putative PAS/PAC sensor protein  44.97 
 
 
178 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1325  methyl-accepting chemotaxis protein  47.5 
 
 
164 aa  155  3e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0735034  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1206  methyl-accepting chemotaxis protein  46.88 
 
 
164 aa  155  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4977  putative PAS/PAC sensor protein  43.2 
 
 
177 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0964  putative PAS domain signal transduction sensor protein  44.1 
 
 
163 aa  154  6e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.695373  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4975  putative PAS/PAC sensor protein  44.38 
 
 
178 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161434  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0540  methyl-accepting chemotaxis protein  45.96 
 
 
166 aa  152  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1413  putative PAS/PAC sensor protein  42.94 
 
 
185 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.026067  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1323  methyl-accepting chemotaxis protein  44.38 
 
 
165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4683  putative PAS/PAC sensor protein  44.79 
 
 
173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1204  methyl-accepting chemotaxis protein  44.38 
 
 
165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3403  PAS sensor protein  44.79 
 
 
189 aa  151  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0963  putative PAS domain signal transduction sensor protein  43.75 
 
 
163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.598174  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1312  putative PAS/PAC sensor protein  44.17 
 
 
174 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  0.171791 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2936  putative PAS/PAC sensor protein  41.76 
 
 
201 aa  145  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178135  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.59 
 
 
174 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4792  putative PAS/PAC sensor protein  41.1 
 
 
174 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3464  transcriptional regulator  39.08 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1521  putative PAS/PAC sensor protein  40.61 
 
 
228 aa  136  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.950455  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2525  putative PAS/PAC sensor protein  43.95 
 
 
208 aa  134  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0659487  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2233  putative PAS/PAC sensor protein  38.92 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1378  putative PAS/PAC sensor protein  39.39 
 
 
200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1522  PAS sensor protein  38.65 
 
 
225 aa  126  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.533099  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1964  putative PAS/PAC sensor protein  41.82 
 
 
229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0729  PAS  40.85 
 
 
945 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0635035  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1652  putative PAS/PAC sensor protein  44.8 
 
 
127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.129926  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.54 
 
 
521 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.258308  normal  0.504821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.82 
 
 
550 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6942  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.73 
 
 
566 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3595  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 
515 aa  114  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4027  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.35 
 
 
521 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664053  normal  0.0821551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.45 
 
 
556 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1648  aerotaxis receptor  41.35 
 
 
521 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3735  PAS  42.11 
 
 
521 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2022  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.01 
 
 
748 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.93 
 
 
561 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2812  putative PAS/PAC sensor protein  42.15 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.494423  decreased coverage  0.000000324615 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.46 
 
 
519 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.29 
 
 
520 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0725  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.46 
 
 
495 aa  112  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4521  aerotaxis receptor, putative  40.6 
 
 
521 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1487  PAS domain-containing protein  42.28 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000133262  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer, Pas/Pac sensor  41.01 
 
 
565 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1390  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.6 
 
 
534 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  41.94 
 
 
714 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1888  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.11 
 
 
521 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.378373  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24380  aerotaxis receptor Aer  40.94 
 
 
567 aa  110  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.78 
 
 
519 aa  110  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3270  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
532 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.415489  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.46 
 
 
519 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0064  PAS sensor protein  38.69 
 
 
456 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106866  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.11 
 
 
521 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.44 
 
 
543 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 
521 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00326538  normal  0.948878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.44 
 
 
551 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510218  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03711  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  38.64 
 
 
529 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.611118 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0995  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.18 
 
 
517 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2257  aerotaxis receptor Aer-1  45.22 
 
 
521 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215452  normal  0.0215353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2014  aerotaxis receptor  40.15 
 
 
521 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
522 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0615962  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0532  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.04 
 
 
523 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0374128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
522 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1125  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.32 
 
 
532 aa  108  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3073  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.86 
 
 
522 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000166485 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.19 
 
 
524 aa  107  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.1 
 
 
521 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.629648  normal  0.0156802 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1860  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.04 
 
 
524 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0659  putative PAS/PAC sensor protein  40.98 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2125  methyl-accepting chemotaxis protein  35.67 
 
 
514 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.06 
 
 
506 aa  107  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.538358 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3406  PAS  40.91 
 
 
521 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387271  normal  0.671486 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
522 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0176898 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0530  methyl-accepting chemotaxis protein  41.48 
 
 
569 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667624  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3951  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.29 
 
 
529 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226395  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3366  aerotaxis receptor  39.23 
 
 
506 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.775088  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.69 
 
 
954 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4385  aerotaxis receptor  38.69 
 
 
506 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.472426  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.23 
 
 
506 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3538  aerotaxis receptor  39.23 
 
 
506 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3508  aerotaxis receptor  39.23 
 
 
506 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.67 
 
 
716 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.29 
 
 
529 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02941  fused signal transducer for aerotaxis sensory component/methyl accepting chemotaxis component  39.23 
 
 
506 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  39.23 
 
 
506 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1294  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.64 
 
 
575 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00873235 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3253  aerotaxis receptor  39.23 
 
 
506 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2920  aerotaxis sensor receptor  39.72 
 
 
549 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>