211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0937 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0937  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 		 260 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.156441  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0848  heat-inducible transcription repressor  57.03 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0773  heat-inducible transcription repressor  56.6 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.149257  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1260  heat-inducible transcription repressor  50.57 
 
 		 240 aa  246  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.775914  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0151  heat-inducible transcription repressor  47.73 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000619699  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1121  heat-inducible transcription repressor  46.72 
 
 		 262 aa  241  7.999999999999999e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000692409  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2044  heat-inducible transcription repressor  45.77 
 
 		 267 aa  239  5e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0514653  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1091  heat-inducible transcription repressor  45.74 
 
 		 262 aa  235  7e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000108949  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1360  heat-inducible transcription repressor  36.57 
 
 		 267 aa  165  5e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000135051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.74 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2097  negative regulator of class I heat shock protein  40.79 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.7 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.28 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3244  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.42 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1515  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.71 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1823  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.96 
 
 		 335 aa  55.5  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 354 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2417  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.56 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  36.62 
 
 		 372 aa  54.3  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.68 
 
 		 345 aa  53.9  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.21 
 
 		 355 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.85 
 
 		 363 aa  52  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  32.35 
 
 		 352 aa  52.4  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_002620  TC0673  heat-inducible transcription repressor  39.53 
 
 		 392 aa  52  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.538731  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  38.03 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  39.06 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  38.03 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.78 
 
 		 351 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0763  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.58 
 
 		 336 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.94526  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1025  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 		 347 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000723404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.94 
 
 		 351 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.76 
 
 		 337 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.73 
 
 		 338 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  27.78 
 
 		 339 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.21 
 
 		 348 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.06 
 
 		 346 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 342 aa  50.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  38.1 
 
 		 339 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3005  heat-inducible transcription repressor  32.94 
 
 		 359 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.51 
 
 		 337 aa  50.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 340 aa  49.7  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.68 
 
 		 340 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.71 
 
 		 341 aa  49.7  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 		 337 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1360  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.84 
 
 		 343 aa  49.7  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.86 
 
 		 351 aa  49.7  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26961  negative regulator of class I heat shock protein  32.39 
 
 		 352 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.68 
 
 		 340 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  33.82 
 
 		 367 aa  49.7  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1294  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.23 
 
 		 336 aa  49.7  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.190693  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  36.51 
 
 		 336 aa  49.3  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0076  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.5 
 
 		 338 aa  49.3  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  34.78 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0076  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.5 
 
 		 338 aa  49.3  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666316  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.21 
 
 		 336 aa  48.9  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  34.78 
 
 		 337 aa  48.9  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.36 
 
 		 344 aa  48.9  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.98 
 
 		 344 aa  48.9  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  35.94 
 
 		 339 aa  48.9  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  36.76 
 
 		 334 aa  48.9  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.48 
 
 		 350 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  35.29 
 
 		 336 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 		 339 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.25 
 
 		 340 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.18 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.88 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0207  heat-inducible transcription repressor  30.59 
 
 		 354 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.29 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.88 
 
 		 343 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.94 
 
 		 340 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  27.52 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.88 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.68 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  33.82 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  36.76 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  31.71 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  31.71 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  33.82 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3464  heat-inducible transcription repressor  34.12 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  34.15 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.39 
 
 		 357 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.91 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  33.82 
 
 		 334 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  35.94 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  34.94 
 
 		 336 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.22 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.71 
 
 		 342 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.9 
 
 		 345 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  32.35 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0367  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.39 
 
 		 340 aa  47  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2873  heat-inducible transcription repressor  35.94 
 
 		 354 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  29.17 
 
 		 340 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  37.88 
 
 		 339 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  37.88 
 
 		 339 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  29.17 
 
 		 340 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.96 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  29.17 
 
 		 340 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1183  heat-inducible transcription repressor  28.87 
 
 		 345 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>