250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7058 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 		 343 aa  686    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  65.28 
 
 		 337 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  64.69 
 
 		 337 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  64.9 
 
 		 337 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  64.9 
 
 		 339 aa  412  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  64.71 
 
 		 340 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  63.31 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  60.42 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  61.06 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.72 
 
 		 340 aa  391  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.25 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  61.36 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  59.94 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  60 
 
 		 340 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.95 
 
 		 340 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  60.88 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  61.05 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  58.04 
 
 		 341 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  60.95 
 
 		 337 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  61.31 
 
 		 341 aa  364  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.58 
 
 		 340 aa  362  6e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  56.08 
 
 		 343 aa  361  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  55.92 
 
 		 343 aa  360  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  55.03 
 
 		 343 aa  359  4e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  56.3 
 
 		 347 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  56.3 
 
 		 347 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  56.3 
 
 		 347 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  57.14 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.93 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.48 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.08 
 
 		 339 aa  344  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.94 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  53.08 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.68 
 
 		 350 aa  323  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.99 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  50.89 
 
 		 336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  42.55 
 
 		 372 aa  262  6.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.8 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.78 
 
 		 347 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.15 
 
 		 344 aa  195  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  38.64 
 
 		 336 aa  195  7e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  36.36 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.53 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.15 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.32 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.96 
 
 		 345 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 343 aa  189  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.27 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.73 
 
 		 343 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  33.52 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  30.38 
 
 		 339 aa  182  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  29.67 
 
 		 339 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.46 
 
 		 337 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.75 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.9 
 
 		 357 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.34 
 
 		 351 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.85 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.91 
 
 		 348 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.12 
 
 		 341 aa  175  9e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  35.38 
 
 		 367 aa  169  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.14 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.23 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  30.03 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  33.62 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.82 
 
 		 342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.64 
 
 		 357 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  31.12 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.81 
 
 		 363 aa  165  8e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.05 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  31.1 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  30.82 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.48 
 
 		 348 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  29.68 
 
 		 360 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  30.82 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  30.51 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  30.51 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  30.21 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  33.63 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  30.21 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  30.21 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  30.84 
 
 		 342 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 		 362 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  30.21 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.41 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  30.21 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  32.76 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  33.52 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.99 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  30.21 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0394  heat-inducible transcription repressor  32.66 
 
 		 362 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.52 
 
 		 355 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.91 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.91 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.77 
 
 		 354 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.29 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.92 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  32.18 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>