226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0151 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0151  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 
264 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000619699  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2044  heat-inducible transcription repressor  72.35 
 
 
267 aa  408  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0514653  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1091  heat-inducible transcription repressor  58.02 
 
 
262 aa  308  5e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000108949  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1121  heat-inducible transcription repressor  54.58 
 
 
262 aa  297  9e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000692409  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0937  heat-inducible transcription repressor  47.73 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.156441  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0773  heat-inducible transcription repressor  44.53 
 
 
263 aa  229  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.149257  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0848  heat-inducible transcription repressor  44.15 
 
 
264 aa  229  5e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1260  heat-inducible transcription repressor  40.75 
 
 
240 aa  191  7e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.775914  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1360  heat-inducible transcription repressor  38.06 
 
 
267 aa  185  7e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000135051  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1360  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.37 
 
 
343 aa  58.9  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.67 
 
 
354 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  36.76 
 
 
340 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1823  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.36 
 
 
335 aa  56.2  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22958  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.76 
 
 
340 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  39.71 
 
 
343 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.92 
 
 
337 aa  55.8  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  39.06 
 
 
339 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3244  heat-inducible transcription repressor HrcA  45.59 
 
 
347 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.5 
 
 
337 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.76 
 
 
340 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.62 
 
 
346 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.5 
 
 
337 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  36.36 
 
 
337 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0367  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.53 
 
 
340 aa  53.5  0.000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0763  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.36 
 
 
336 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.94526  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.94 
 
 
345 aa  52.8  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  38.98 
 
 
339 aa  52.8  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  35.44 
 
 
334 aa  52.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1183  heat-inducible transcription repressor  30 
 
 
345 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556143  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  34.62 
 
 
336 aa  53.1  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  38.1 
 
 
341 aa  52.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0673  heat-inducible transcription repressor  40.54 
 
 
392 aa  52.4  0.000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.538731  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  42.37 
 
 
337 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  42.37 
 
 
337 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1401  heat-inducible transcription repressor HrcA  30 
 
 
345 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.9 
 
 
325 aa  52  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.68 
 
 
336 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.39 
 
 
350 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1674  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.18 
 
 
325 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0089  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.47 
 
 
337 aa  51.6  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000627651  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.39 
 
 
355 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.05 
 
 
351 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0076  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.04 
 
 
338 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1210  heat-inducible transcription repressor HrcA  30 
 
 
345 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297014  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1640  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.18 
 
 
325 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.407829  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.31 
 
 
352 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 
339 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
344 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.58 
 
 
355 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 
339 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  35.38 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.38 
 
 
340 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.88 
 
 
343 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.38 
 
 
340 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.94 
 
 
340 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.29 
 
 
337 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0076  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.58 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.12 
 
 
342 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  30 
 
 
338 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  34.29 
 
 
339 aa  50.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  34.09 
 
 
344 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.88 
 
 
357 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.76 
 
 
339 aa  50.4  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.42 
 
 
351 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  35.94 
 
 
343 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  30.12 
 
 
334 aa  50.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.89 
 
 
344 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  32.81 
 
 
372 aa  49.7  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 
344 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  32.58 
 
 
350 aa  49.7  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.94 
 
 
344 aa  49.3  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1025  heat-inducible transcription repressor  33.7 
 
 
347 aa  49.3  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000723404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  32 
 
 
343 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.26 
 
 
357 aa  49.3  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 
334 aa  49.3  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  32 
 
 
343 aa  49.3  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.56 
 
 
343 aa  48.9  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
340 aa  48.9  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  24.75 
 
 
347 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.74 
 
 
344 aa  48.9  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  24.75 
 
 
347 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  24.75 
 
 
347 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  33.8 
 
 
343 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.71 
 
 
363 aa  48.9  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.25 
 
 
340 aa  48.9  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.58 
 
 
348 aa  48.9  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  33.8 
 
 
343 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.9 
 
 
354 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.59 
 
 
342 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  33.33 
 
 
348 aa  48.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  30 
 
 
342 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  33.8 
 
 
339 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  33.8 
 
 
339 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3005  heat-inducible transcription repressor  35.94 
 
 
359 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  31.17 
 
 
352 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0011  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 
359 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185452 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  37.88 
 
 
336 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  32.35 
 
 
351 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  32 
 
 
367 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>