249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0011 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0011  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 
359 aa  714    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0007  heat-inducible transcription repressor  80.5 
 
 
362 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0007  heat-inducible transcription repressor  80.22 
 
 
362 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.215417  normal  0.108375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0398  heat-inducible transcription repressor  79.55 
 
 
360 aa  566  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0181  heat-inducible transcription repressor  66.85 
 
 
372 aa  498  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0166  heat-inducible transcription repressor  67.8 
 
 
374 aa  496  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0172  heat-inducible transcription repressor  67.8 
 
 
374 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4017  heat-inducible transcription repressor  67.92 
 
 
356 aa  487  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  60.93 
 
 
367 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  60.64 
 
 
367 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2534  heat-inducible transcription repressor  58.76 
 
 
366 aa  414  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  60.06 
 
 
362 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  60.35 
 
 
362 aa  413  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  60.64 
 
 
362 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  60.35 
 
 
362 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0399  heat-inducible transcription repressor  58.97 
 
 
363 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  60.35 
 
 
362 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  59.77 
 
 
362 aa  411  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2944  heat-inducible transcription repressor  57.68 
 
 
372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0432  heat-inducible transcription repressor  58.69 
 
 
363 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0467  heat-inducible transcription repressor  58.12 
 
 
370 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0394  heat-inducible transcription repressor  58.89 
 
 
362 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1266  heat-inducible transcription repressor  58.6 
 
 
366 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0103094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  56.61 
 
 
354 aa  398  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2324  heat-inducible transcription repressor  57.1 
 
 
364 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  50.57 
 
 
352 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0207  heat-inducible transcription repressor  54.42 
 
 
354 aa  355  7.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0166  heat-inducible transcription repressor  53.64 
 
 
358 aa  352  7e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.714476  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  51.6 
 
 
367 aa  351  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  50 
 
 
355 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2657  heat-inducible transcription repressor  54.34 
 
 
350 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44913  normal  0.911216 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0009  heat-inducible transcription repressor  53.71 
 
 
351 aa  338  8e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3464  heat-inducible transcription repressor  53.45 
 
 
354 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1220  heat-inducible transcription repressor  53.18 
 
 
356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3005  heat-inducible transcription repressor  51.88 
 
 
359 aa  336  2.9999999999999997e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2881  heat-inducible transcription repressor  53.2 
 
 
346 aa  335  9e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2873  heat-inducible transcription repressor  52.71 
 
 
354 aa  332  5e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0253  heat-inducible transcription repressor  53.04 
 
 
347 aa  323  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.261487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0566  heat-inducible transcription repressor  51.88 
 
 
342 aa  300  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.360767  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2060  heat-inducible transcription repressor  46.65 
 
 
354 aa  266  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  39.18 
 
 
340 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  39.88 
 
 
336 aa  252  7e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  38.42 
 
 
339 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  39.88 
 
 
339 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  39.59 
 
 
336 aa  250  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  39.94 
 
 
340 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  39.47 
 
 
340 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  39.47 
 
 
340 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  39.47 
 
 
385 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  39.47 
 
 
385 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  39.47 
 
 
340 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  39.47 
 
 
340 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  39.47 
 
 
340 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  38.33 
 
 
340 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  38.33 
 
 
340 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  38.6 
 
 
340 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  38.6 
 
 
340 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  38.6 
 
 
340 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.37 
 
 
343 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  38.12 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  39.48 
 
 
342 aa  243  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  39.94 
 
 
345 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  38.14 
 
 
352 aa  242  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  38.42 
 
 
334 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  37.85 
 
 
352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  39 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  38.42 
 
 
338 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  39.3 
 
 
334 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  39 
 
 
337 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  37.57 
 
 
352 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  39.37 
 
 
348 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  39 
 
 
334 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  38.42 
 
 
336 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  37.61 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  37.32 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.71 
 
 
351 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  37.39 
 
 
342 aa  229  6e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  36.15 
 
 
339 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  38.12 
 
 
341 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.78 
 
 
343 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2032  heat-inducible transcription repressor  39.07 
 
 
339 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  38.19 
 
 
342 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.3 
 
 
350 aa  225  8e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.24 
 
 
351 aa  225  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  35.92 
 
 
334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  38.6 
 
 
349 aa  222  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.48 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.9 
 
 
343 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.34 
 
 
342 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.67 
 
 
357 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.73 
 
 
350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  34.88 
 
 
343 aa  216  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.46 
 
 
343 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.78 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  35.96 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  34.38 
 
 
349 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  34.38 
 
 
349 aa  209  6e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.67 
 
 
357 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1598  heat-inducible transcription repressor  36.65 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.951274  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.65 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>