229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2044 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2044  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 		 267 aa  543  1e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0514653  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0151  heat-inducible transcription repressor  72.35 
 
 		 264 aa  408  1e-113  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000619699  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1091  heat-inducible transcription repressor  59.92 
 
 		 262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000108949  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1121  heat-inducible transcription repressor  52.29 
 
 		 262 aa  292  4e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000692409  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0937  heat-inducible transcription repressor  45.77 
 
 		 260 aa  239  5e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.156441  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0848  heat-inducible transcription repressor  46.74 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0773  heat-inducible transcription repressor  45.59 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.149257  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1260  heat-inducible transcription repressor  41.76 
 
 		 240 aa  191  9e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.775914  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1360  heat-inducible transcription repressor  34.18 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000135051  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1360  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.44 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1823  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.68 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3244  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.84 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  32.47 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.14 
 
 		 355 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0673  heat-inducible transcription repressor  35.48 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.538731  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  38.57 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0763  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.52 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.94526  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  35.06 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  38.57 
 
 		 337 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.12 
 
 		 351 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.72 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 		 339 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.92 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.8 
 
 		 336 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  30.59 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  36.36 
 
 		 337 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.89 
 
 		 350 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.71 
 
 		 325 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  39.06 
 
 		 352 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  38.98 
 
 		 339 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.5 
 
 		 351 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.06 
 
 		 346 aa  53.1  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.38 
 
 		 345 aa  52.8  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 		 344 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.35 
 
 		 340 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.58 
 
 		 342 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.51 
 
 		 340 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.57 
 
 		 343 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.71 
 
 		 342 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.31 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.57 
 
 		 343 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.57 
 
 		 365 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  30 
 
 		 341 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  36.11 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.14 
 
 		 363 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.88 
 
 		 343 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.29 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.07 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0367  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.47 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  32.47 
 
 		 334 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  31.58 
 
 		 339 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1025  heat-inducible transcription repressor  34.35 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000723404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.1 
 
 		 348 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 339 aa  50.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.44 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  33.77 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  31.17 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  36.11 
 
 		 336 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1674  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.75 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.78 
 
 		 350 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  35.62 
 
 		 334 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1349  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.77 
 
 		 341 aa  50.1  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  32.47 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  22.77 
 
 		 343 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1640  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.75 
 
 		 325 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.407829  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  34.33 
 
 		 341 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.19 
 
 		 344 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.36 
 
 		 343 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  28.92 
 
 		 342 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.98 
 
 		 340 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.29 
 
 		 340 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1183  heat-inducible transcription repressor  29.17 
 
 		 345 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  22.66 
 
 		 347 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  22.66 
 
 		 347 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.49 
 
 		 344 aa  49.7  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  22.66 
 
 		 347 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.82 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  29.27 
 
 		 342 aa  49.3  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.82 
 
 		 354 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  22.97 
 
 		 343 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  33.9 
 
 		 340 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  29.87 
 
 		 334 aa  49.3  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  35.71 
 
 		 339 aa  48.9  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  29.87 
 
 		 334 aa  49.3  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.98 
 
 		 357 aa  49.3  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  29.89 
 
 		 336 aa  48.9  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  37.29 
 
 		 343 aa  48.9  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.8 
 
 		 357 aa  48.9  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  33.33 
 
 		 348 aa  48.9  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  30.43 
 
 		 338 aa  48.9  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.07 
 
 		 345 aa  48.9  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  31.17 
 
 		 334 aa  48.9  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1515  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.18 
 
 		 342 aa  48.9  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.86 
 
 		 340 aa  48.9  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.86 
 
 		 340 aa  48.9  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3464  heat-inducible transcription repressor  36.36 
 
 		 354 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0166  heat-inducible transcription repressor  32.91 
 
 		 358 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.714476  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.56 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.36 
 
 		 341 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>