250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07690 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  100 
 
 
336 aa  671    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.28 
 
 
337 aa  373  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  51.31 
 
 
336 aa  332  8e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.37 
 
 
337 aa  202  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.71 
 
 
337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  39.71 
 
 
351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  39.41 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  38.44 
 
 
343 aa  197  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.18 
 
 
340 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  38.64 
 
 
343 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  37.9 
 
 
339 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  38.99 
 
 
340 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  38.3 
 
 
339 aa  192  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.17 
 
 
337 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.27 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.82 
 
 
340 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  38.69 
 
 
341 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.39 
 
 
340 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  37.61 
 
 
339 aa  186  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.56 
 
 
347 aa  185  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.24 
 
 
351 aa  183  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.46 
 
 
340 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.69 
 
 
344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  37.28 
 
 
347 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  37.28 
 
 
347 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  37.28 
 
 
347 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.41 
 
 
343 aa  179  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  38.07 
 
 
337 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.66 
 
 
340 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.46 
 
 
346 aa  176  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  35.84 
 
 
337 aa  176  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  32 
 
 
344 aa  176  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  35.94 
 
 
343 aa  175  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.56 
 
 
347 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.72 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.54 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  35.26 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  32.96 
 
 
360 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.17 
 
 
346 aa  172  9e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  34.5 
 
 
343 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.86 
 
 
341 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 
345 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.11 
 
 
337 aa  169  6e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.39 
 
 
344 aa  169  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  35.65 
 
 
337 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.09 
 
 
343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.18 
 
 
343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.73 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.35 
 
 
343 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.96 
 
 
359 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.67 
 
 
359 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.52 
 
 
355 aa  162  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.03 
 
 
343 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.15 
 
 
351 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 
344 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.27 
 
 
345 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.81 
 
 
350 aa  161  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.94 
 
 
352 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.33 
 
 
343 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.53 
 
 
348 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  28.86 
 
 
344 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.85 
 
 
344 aa  159  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.63 
 
 
336 aa  159  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.25 
 
 
357 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  32.58 
 
 
360 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  32.58 
 
 
360 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.65 
 
 
365 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  32.94 
 
 
365 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.43 
 
 
348 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.65 
 
 
354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  30.64 
 
 
344 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  32.32 
 
 
364 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.12 
 
 
343 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.52 
 
 
342 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  33.04 
 
 
352 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  29.86 
 
 
339 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  30.43 
 
 
339 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.07 
 
 
345 aa  149  6e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.82 
 
 
343 aa  149  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.65 
 
 
350 aa  149  9e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.21 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.11 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.82 
 
 
354 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  29.78 
 
 
372 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1515  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 
342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  30.94 
 
 
370 aa  146  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  29.86 
 
 
357 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.75 
 
 
353 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.75 
 
 
353 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.93 
 
 
373 aa  145  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  28.91 
 
 
348 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  31.53 
 
 
339 aa  142  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.02 
 
 
341 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  31.64 
 
 
355 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.23 
 
 
342 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  32.49 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1210  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.13 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  32.54 
 
 
343 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.7 
 
 
355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  33.53 
 
 
339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0692211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>