250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3244 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3244  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
347 aa  704    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  38.51 
 
 
334 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  37.65 
 
 
334 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.42 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.92 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  37.87 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  38.19 
 
 
342 aa  195  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
343 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.01 
 
 
343 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  35.29 
 
 
349 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 
338 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0166  heat-inducible transcription repressor  36.71 
 
 
358 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.714476  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 
343 aa  192  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.78 
 
 
357 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.57 
 
 
351 aa  192  9e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  35.73 
 
 
352 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  37.13 
 
 
334 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  36.01 
 
 
339 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  36.47 
 
 
337 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  36.69 
 
 
340 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  36.69 
 
 
340 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  36.69 
 
 
340 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  36.69 
 
 
340 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  35.38 
 
 
385 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  35.38 
 
 
385 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  36.8 
 
 
342 aa  186  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  35.91 
 
 
340 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  35.91 
 
 
340 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  35.91 
 
 
340 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  35.91 
 
 
340 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  35.91 
 
 
340 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  36.04 
 
 
342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  35.91 
 
 
340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  35.34 
 
 
367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  36.39 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  36.39 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.87 
 
 
357 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.46 
 
 
344 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  35.31 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  34.4 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  35.69 
 
 
362 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  35.8 
 
 
339 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  36.62 
 
 
354 aa  182  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  36.31 
 
 
362 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.95 
 
 
347 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  35.94 
 
 
362 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  32.34 
 
 
339 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  32.05 
 
 
339 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  34.02 
 
 
341 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  35.63 
 
 
334 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0181  heat-inducible transcription repressor  35.71 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  33.91 
 
 
367 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0398  heat-inducible transcription repressor  36.36 
 
 
360 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  35.65 
 
 
362 aa  180  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  35.17 
 
 
334 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4017  heat-inducible transcription repressor  35.88 
 
 
356 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  35.36 
 
 
362 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.91 
 
 
343 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  34.72 
 
 
336 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 
342 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 
367 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 
343 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0394  heat-inducible transcription repressor  35.94 
 
 
362 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  34.6 
 
 
336 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0172  heat-inducible transcription repressor  36 
 
 
374 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0166  heat-inducible transcription repressor  36 
 
 
374 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0007  heat-inducible transcription repressor  35.47 
 
 
362 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387776 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.5 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.85 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0399  heat-inducible transcription repressor  32.85 
 
 
363 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0467  heat-inducible transcription repressor  33.14 
 
 
370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.95 
 
 
342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  35.29 
 
 
339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0432  heat-inducible transcription repressor  32.85 
 
 
363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  35.69 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0007  heat-inducible transcription repressor  34.69 
 
 
362 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.215417  normal  0.108375 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.04 
 
 
348 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  34.94 
 
 
343 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.52 
 
 
352 aa  172  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  32.75 
 
 
339 aa  172  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  33.89 
 
 
352 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  33.89 
 
 
352 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  34.78 
 
 
362 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2944  heat-inducible transcription repressor  32.94 
 
 
372 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0011  heat-inducible transcription repressor  34.39 
 
 
359 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185452 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 
351 aa  170  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2534  heat-inducible transcription repressor  34.77 
 
 
366 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  34.2 
 
 
345 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.54 
 
 
344 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  33.81 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3464  heat-inducible transcription repressor  34.1 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.71 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.99 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1220  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 
356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.81 
 
 
354 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  30.56 
 
 
349 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2881  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 
346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.88 
 
 
355 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  30.45 
 
 
349 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>