250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1195 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 355 aa  705    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.46 
 
 		 355 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.32 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  46.8 
 
 		 342 aa  296  5e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.03 
 
 		 338 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.9 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.89 
 
 		 343 aa  232  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.66 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.08 
 
 		 342 aa  226  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.42 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.16 
 
 		 348 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.5 
 
 		 351 aa  206  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.31 
 
 		 357 aa  202  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.14 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.21 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  37.61 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.26 
 
 		 343 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.17 
 
 		 345 aa  198  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.67 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.58 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  34.49 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  32.65 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  32.36 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  34.9 
 
 		 349 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.62 
 
 		 344 aa  190  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0970  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.59 
 
 		 350 aa  189  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477518  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  35.4 
 
 		 342 aa  188  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.77 
 
 		 350 aa  186  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.95 
 
 		 348 aa  185  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  33.82 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  33.72 
 
 		 342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 337 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.36 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  30.72 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  34.11 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 353 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.95 
 
 		 355 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 353 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  32.94 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  31.88 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  32.94 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  28.61 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  28.32 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  35.4 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1598  heat-inducible transcription repressor  35.07 
 
 		 354 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.951274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.79 
 
 		 347 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.57 
 
 		 345 aa  175  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  32.59 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  32.31 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  32.84 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  28.12 
 
 		 338 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2032  heat-inducible transcription repressor  33.63 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  32.15 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  28.41 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  32.56 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.78 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  28.41 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  28.74 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  32.47 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  28.41 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  31.75 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1266  heat-inducible transcription repressor  35.71 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0103094 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  28.41 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  28.41 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  32.66 
 
 		 385 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  32.66 
 
 		 385 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  28.41 
 
 		 338 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  32.66 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  29.03 
 
 		 344 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  32.66 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  32.66 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  32.66 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  32.66 
 
 		 340 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2324  heat-inducible transcription repressor  34.56 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528523 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.55 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  27.71 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  28.41 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  28.41 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  32.66 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  32.15 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.38 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  31.59 
 
 		 334 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  32.15 
 
 		 339 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  32.75 
 
 		 340 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  27.14 
 
 		 343 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  31.59 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  31.01 
 
 		 345 aa  166  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  30.79 
 
 		 348 aa  165  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.95 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3005  heat-inducible transcription repressor  35.14 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  33.62 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  32.08 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  32.46 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  32.46 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  32.08 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  32.46 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>