250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1406 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
343 aa  694    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  66.86 
 
 
344 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  61.76 
 
 
343 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.48 
 
 
343 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  59 
 
 
342 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.59 
 
 
343 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  60 
 
 
343 aa  411  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.11 
 
 
357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.18 
 
 
348 aa  293  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.23 
 
 
350 aa  271  8.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.74 
 
 
351 aa  272  8.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.23 
 
 
357 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  42.98 
 
 
355 aa  263  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  39.82 
 
 
343 aa  262  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.53 
 
 
354 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  39.17 
 
 
349 aa  261  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  39.77 
 
 
352 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  38.87 
 
 
349 aa  260  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  41.45 
 
 
349 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.18 
 
 
351 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  40.53 
 
 
334 aa  256  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  39.88 
 
 
340 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  39.88 
 
 
340 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  41.42 
 
 
342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1598  heat-inducible transcription repressor  40.6 
 
 
354 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.951274  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  39.41 
 
 
340 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  39.41 
 
 
340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  39.41 
 
 
340 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  39.41 
 
 
340 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  40.41 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  38.6 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  38.6 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  38.82 
 
 
340 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  38.82 
 
 
340 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  38.82 
 
 
340 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  38.82 
 
 
340 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  38.82 
 
 
340 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  38.82 
 
 
340 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.02 
 
 
355 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  40.12 
 
 
334 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  39.82 
 
 
338 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  39.59 
 
 
342 aa  249  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  39.71 
 
 
339 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  39.12 
 
 
339 aa  248  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.37 
 
 
353 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.37 
 
 
353 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  40.41 
 
 
342 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  40 
 
 
339 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  39.23 
 
 
337 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  38.18 
 
 
354 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  35.88 
 
 
339 aa  247  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.47 
 
 
350 aa  245  8e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  39.71 
 
 
341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  39.23 
 
 
334 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  39.12 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  39.14 
 
 
367 aa  243  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4017  heat-inducible transcription repressor  41.57 
 
 
356 aa  242  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  38.84 
 
 
334 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.71 
 
 
354 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  38.64 
 
 
334 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  37.32 
 
 
345 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  41.62 
 
 
367 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  36.47 
 
 
336 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.9 
 
 
345 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  42.2 
 
 
367 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  36.81 
 
 
348 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2944  heat-inducible transcription repressor  40.87 
 
 
372 aa  235  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.15 
 
 
342 aa  235  9e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0970  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.35 
 
 
350 aa  235  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477518  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  37.57 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  40.06 
 
 
362 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.41 
 
 
347 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  37.11 
 
 
352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0181  heat-inducible transcription repressor  38.95 
 
 
372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.89 
 
 
355 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  39.77 
 
 
362 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  37.68 
 
 
352 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  36.18 
 
 
336 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0172  heat-inducible transcription repressor  38.37 
 
 
374 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0166  heat-inducible transcription repressor  38.19 
 
 
358 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.714476  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  33.72 
 
 
342 aa  229  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0166  heat-inducible transcription repressor  38.37 
 
 
374 aa  229  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  37.11 
 
 
352 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.35 
 
 
338 aa  228  8e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.47 
 
 
351 aa  228  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  38.44 
 
 
362 aa  228  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.22 
 
 
345 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2032  heat-inducible transcription repressor  38.46 
 
 
339 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0394  heat-inducible transcription repressor  39.48 
 
 
362 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0432  heat-inducible transcription repressor  39.24 
 
 
363 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  38.33 
 
 
362 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0399  heat-inducible transcription repressor  39.24 
 
 
363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1266  heat-inducible transcription repressor  38.95 
 
 
366 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0103094 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.22 
 
 
344 aa  223  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3005  heat-inducible transcription repressor  38.08 
 
 
359 aa  223  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  38.44 
 
 
362 aa  222  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2534  heat-inducible transcription repressor  38.26 
 
 
366 aa  222  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.62 
 
 
340 aa  222  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.62 
 
 
340 aa  222  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0007  heat-inducible transcription repressor  38.22 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>