250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2882 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
338 aa  685    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.81 
 
 
342 aa  294  1e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.82 
 
 
354 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.03 
 
 
355 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.91 
 
 
355 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.78 
 
 
344 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.35 
 
 
343 aa  228  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.59 
 
 
343 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.1 
 
 
343 aa  225  9e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.29 
 
 
348 aa  212  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.51 
 
 
357 aa  209  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.51 
 
 
342 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.21 
 
 
343 aa  192  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  33.72 
 
 
342 aa  192  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.81 
 
 
343 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  31.96 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  33.53 
 
 
352 aa  189  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.3 
 
 
354 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0970  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.8 
 
 
350 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  32.94 
 
 
342 aa  185  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.99 
 
 
345 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.41 
 
 
347 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 
350 aa  179  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  34.88 
 
 
367 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  35.47 
 
 
367 aa  179  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  31.66 
 
 
349 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.44 
 
 
340 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.16 
 
 
351 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  31.95 
 
 
349 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.44 
 
 
340 aa  177  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  32.16 
 
 
342 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.7 
 
 
352 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 
355 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  31.67 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0181  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.35 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0172  heat-inducible transcription repressor  32.85 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0166  heat-inducible transcription repressor  32.85 
 
 
374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.29 
 
 
353 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.29 
 
 
353 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.79 
 
 
344 aa  172  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1598  heat-inducible transcription repressor  33.63 
 
 
354 aa  172  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.951274  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  31.09 
 
 
352 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  31.18 
 
 
352 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2944  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 
372 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  31.5 
 
 
349 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2324  heat-inducible transcription repressor  34.18 
 
 
364 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1266  heat-inducible transcription repressor  33.52 
 
 
366 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0103094 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  32.19 
 
 
357 aa  170  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  30.64 
 
 
352 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.86 
 
 
345 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2032  heat-inducible transcription repressor  33.14 
 
 
339 aa  169  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.35 
 
 
351 aa  169  6e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  32.46 
 
 
362 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  34.8 
 
 
355 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  30.55 
 
 
348 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.64 
 
 
355 aa  168  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.37 
 
 
343 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0166  heat-inducible transcription repressor  30.12 
 
 
358 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.714476  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  30 
 
 
350 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  30.81 
 
 
345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  31.98 
 
 
362 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2534  heat-inducible transcription repressor  31.88 
 
 
366 aa  165  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  29.59 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  31.4 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  31.88 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  28.61 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  31.4 
 
 
362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.38 
 
 
357 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.23 
 
 
344 aa  162  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.61 
 
 
348 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4017  heat-inducible transcription repressor  31.88 
 
 
356 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  31.44 
 
 
354 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0399  heat-inducible transcription repressor  32.46 
 
 
363 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  28.91 
 
 
336 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  31.78 
 
 
334 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.19 
 
 
351 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0394  heat-inducible transcription repressor  31.4 
 
 
362 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  30.03 
 
 
336 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  29.24 
 
 
348 aa  160  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0432  heat-inducible transcription repressor  32.16 
 
 
363 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  31.78 
 
 
334 aa  159  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  31.47 
 
 
367 aa  159  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  30.97 
 
 
334 aa  159  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  31.69 
 
 
362 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3005  heat-inducible transcription repressor  31.88 
 
 
359 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0011  heat-inducible transcription repressor  28.78 
 
 
359 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  34.21 
 
 
337 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  26.09 
 
 
339 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0467  heat-inducible transcription repressor  32.16 
 
 
370 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  31.56 
 
 
337 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  30.29 
 
 
385 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0398  heat-inducible transcription repressor  29.39 
 
 
360 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  30.64 
 
 
342 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  30.29 
 
 
385 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  30.38 
 
 
340 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  31.29 
 
 
338 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  30.38 
 
 
340 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  30.38 
 
 
340 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  30.88 
 
 
343 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>