249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1324 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 351 aa  711    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.07 
 
 		 348 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  46.49 
 
 		 343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.99 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  44.51 
 
 		 339 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  44.51 
 
 		 339 aa  292  7e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.58 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.41 
 
 		 343 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.07 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  39.4 
 
 		 344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  40.18 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.37 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.24 
 
 		 345 aa  255  7e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.92 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.39 
 
 		 343 aa  249  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  37.79 
 
 		 338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  37.79 
 
 		 338 aa  246  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  37.79 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  37.21 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  37.79 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  37.79 
 
 		 338 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 		 338 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.31 
 
 		 343 aa  243  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  37.79 
 
 		 338 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  37.79 
 
 		 338 aa  243  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  37.35 
 
 		 343 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.47 
 
 		 341 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.34 
 
 		 344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.29 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.6 
 
 		 343 aa  235  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.88 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.47 
 
 		 343 aa  228  9e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.69 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.39 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 		 348 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.04 
 
 		 343 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.75 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.05 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.63 
 
 		 357 aa  215  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.62 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.61 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.23 
 
 		 342 aa  199  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.83 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.53 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.73 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  32.28 
 
 		 336 aa  196  7e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.41 
 
 		 359 aa  195  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.78 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  32.37 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  30.66 
 
 		 341 aa  192  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  31.33 
 
 		 342 aa  192  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.73 
 
 		 354 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  29.43 
 
 		 351 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  34 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.66 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  31.87 
 
 		 360 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.03 
 
 		 344 aa  189  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.07 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.3 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  29.33 
 
 		 364 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  30.91 
 
 		 336 aa  186  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  30.06 
 
 		 349 aa  186  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.75 
 
 		 355 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.56 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  28.83 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_002936  DET1401  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.86 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.02 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.4 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.02 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  29.26 
 
 		 352 aa  183  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.26 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  30.42 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  29.09 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1168  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.97 
 
 		 337 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  30.63 
 
 		 347 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.94 
 
 		 340 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  30.63 
 
 		 347 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  30.63 
 
 		 347 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  30.11 
 
 		 370 aa  182  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  28.88 
 
 		 339 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  30.68 
 
 		 343 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  31.21 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.27 
 
 		 357 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.5 
 
 		 344 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.7 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.36 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1183  heat-inducible transcription repressor  32.47 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556143  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  29.71 
 
 		 341 aa  180  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.48 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  30 
 
 		 343 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  29.34 
 
 		 343 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.06 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  29.73 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  29.01 
 
 		 339 aa  179  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.9 
 
 		 350 aa  179  9e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.09 
 
 		 340 aa  179  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.09 
 
 		 340 aa  179  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  29.14 
 
 		 339 aa  179  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  29.79 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>