246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_12820 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 347 aa  702    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.23 
 
 		 343 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.55 
 
 		 347 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.58 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.32 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.44 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.93 
 
 		 343 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.13 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.13 
 
 		 345 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.46 
 
 		 341 aa  239  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.29 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.26 
 
 		 345 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  34.1 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  39.05 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  39.05 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 344 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.52 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  35.96 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.53 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.02 
 
 		 337 aa  216  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  35.58 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  35.28 
 
 		 338 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  35.28 
 
 		 338 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  35.28 
 
 		 338 aa  212  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  35.06 
 
 		 338 aa  212  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  34.76 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  35.06 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  35.28 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  35.28 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.86 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  34.76 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  31.46 
 
 		 351 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 343 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  32.06 
 
 		 340 aa  205  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.73 
 
 		 357 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.57 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  36.24 
 
 		 360 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.52 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.95 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  32.27 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.94 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  32.27 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.84 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  32.27 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.09 
 
 		 342 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  33.72 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.06 
 
 		 340 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.96 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  32.84 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  31.4 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  33.53 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  31.76 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  31.18 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.71 
 
 		 351 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  33.8 
 
 		 360 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  33.8 
 
 		 360 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.77 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  31.38 
 
 		 339 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.72 
 
 		 348 aa  190  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.43 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  33.13 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.07 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  32.52 
 
 		 370 aa  186  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 343 aa  186  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.38 
 
 		 343 aa  186  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  30.41 
 
 		 343 aa  186  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  32.56 
 
 		 336 aa  185  8e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.66 
 
 		 343 aa  185  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  30.5 
 
 		 339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.31 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  30.68 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.75 
 
 		 359 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.33 
 
 		 344 aa  182  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  32.58 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.54 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.6 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1168  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.55 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  32.56 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.01 
 
 		 357 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  29.41 
 
 		 337 aa  179  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.28 
 
 		 343 aa  179  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0620  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000107992  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.12 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  31.38 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.41 
 
 		 355 aa  177  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  31.56 
 
 		 353 aa  176  6e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.21 
 
 		 355 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.23 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.59 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  32.66 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.17 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.16 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.92 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.92 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  28.45 
 
 		 349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.95 
 
 		 357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.48 
 
 		 357 aa  172  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  32.29 
 
 		 334 aa  173  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>