249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0701 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 337 aa  669    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  77.74 
 
 		 343 aa  522  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  74.4 
 
 		 337 aa  507  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  70.54 
 
 		 337 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  69.91 
 
 		 340 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  64.29 
 
 		 339 aa  427  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  62.61 
 
 		 339 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  64.99 
 
 		 339 aa  420  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  64.69 
 
 		 343 aa  415  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  63.5 
 
 		 340 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  63.31 
 
 		 341 aa  413  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  63.2 
 
 		 351 aa  408  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  61.36 
 
 		 340 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  60.6 
 
 		 340 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  61.01 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  57.86 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.13 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.46 
 
 		 340 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.06 
 
 		 340 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.55 
 
 		 351 aa  356  3.9999999999999996e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  54.68 
 
 		 343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.07 
 
 		 344 aa  351  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  55.49 
 
 		 337 aa  345  5e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.81 
 
 		 341 aa  345  8.999999999999999e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  54.25 
 
 		 347 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  54.25 
 
 		 347 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  54.25 
 
 		 347 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.76 
 
 		 344 aa  342  7e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  51.76 
 
 		 343 aa  338  9e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  53.1 
 
 		 343 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  53.13 
 
 		 339 aa  332  4e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.1 
 
 		 346 aa  330  3e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  54.01 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  50.58 
 
 		 350 aa  312  4.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  53.73 
 
 		 337 aa  293  4e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.16 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  41.85 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.35 
 
 		 345 aa  256  3e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.65 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.84 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.16 
 
 		 343 aa  198  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  33.92 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.8 
 
 		 344 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.84 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  32.63 
 
 		 344 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.58 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  37.17 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.63 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  32.65 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.13 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.12 
 
 		 343 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 343 aa  189  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.55 
 
 		 348 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.49 
 
 		 344 aa  180  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.84 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.06 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.62 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  33.94 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.77 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.9 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.14 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.68 
 
 		 343 aa  172  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.76 
 
 		 357 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.77 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  30 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.87 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  30.42 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.75 
 
 		 350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.31 
 
 		 351 aa  165  8e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  31.76 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.73 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  31.47 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  32.45 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  29.64 
 
 		 338 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.94 
 
 		 357 aa  162  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.36 
 
 		 350 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  29.34 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  29.82 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  29.82 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  29.82 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  31.52 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  29.82 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  29.91 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  29.82 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  31.85 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.75 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  34.85 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.95 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.59 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.59 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.5 
 
 		 363 aa  157  3e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.78 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  31.55 
 
 		 349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.33 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.03 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  31.18 
 
 		 342 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  30.5 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>