250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2109 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 		 339 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  85.84 
 
 		 339 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  67.66 
 
 		 341 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  66.77 
 
 		 337 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  65.57 
 
 		 340 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  66.08 
 
 		 340 aa  425  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  66.67 
 
 		 351 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.61 
 
 		 337 aa  420  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  60.95 
 
 		 343 aa  408  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  61.76 
 
 		 340 aa  401  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  61.29 
 
 		 347 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  61.29 
 
 		 347 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  61.29 
 
 		 347 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  60.88 
 
 		 343 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.76 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  60.24 
 
 		 343 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.43 
 
 		 340 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.09 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  59.64 
 
 		 343 aa  391  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.4 
 
 		 344 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.59 
 
 		 344 aa  388  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  61.06 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  59.94 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  61.49 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  59.82 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.81 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.14 
 
 		 346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  58.41 
 
 		 337 aa  352  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.26 
 
 		 351 aa  348  6e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  56.51 
 
 		 337 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.57 
 
 		 341 aa  346  4e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.26 
 
 		 346 aa  338  7e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.59 
 
 		 340 aa  335  7e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.59 
 
 		 350 aa  316  3e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.63 
 
 		 337 aa  309  4e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  48.35 
 
 		 336 aa  285  9e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.43 
 
 		 345 aa  262  6.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  41.51 
 
 		 372 aa  249  4e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  34.23 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.74 
 
 		 343 aa  203  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  32.43 
 
 		 344 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.65 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.03 
 
 		 343 aa  193  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  38.3 
 
 		 336 aa  192  5e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.06 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.25 
 
 		 337 aa  189  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.38 
 
 		 347 aa  189  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.41 
 
 		 343 aa  189  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.2 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  35 
 
 		 342 aa  186  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.02 
 
 		 344 aa  185  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.63 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.06 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  31.88 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  35.38 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  31.88 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.39 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.14 
 
 		 351 aa  179  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.47 
 
 		 341 aa  179  9e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.86 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.94 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.07 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.23 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  31.48 
 
 		 338 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  31.48 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.1 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.32 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  31.12 
 
 		 339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  31.48 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  31.17 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  31.17 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  30.88 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  31.48 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  31.17 
 
 		 338 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  31.17 
 
 		 338 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  31.17 
 
 		 338 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  30.86 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.62 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.19 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.46 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.36 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  33.81 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.94 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4017  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.2 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.01 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  34.67 
 
 		 362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  34.38 
 
 		 362 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  34.29 
 
 		 367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  33.52 
 
 		 362 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  30.7 
 
 		 349 aa  165  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.5 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.5 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.01 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.75 
 
 		 350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  33.81 
 
 		 354 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0399  heat-inducible transcription repressor  32.85 
 
 		 363 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0432  heat-inducible transcription repressor  32.85 
 
 		 363 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>