254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2766 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 344 aa  671    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  73.26 
 
 		 344 aa  501  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  71.43 
 
 		 347 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  71.43 
 
 		 347 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  71.43 
 
 		 347 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  71.1 
 
 		 343 aa  477  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  70.52 
 
 		 343 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  69.36 
 
 		 343 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  67.44 
 
 		 341 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  64.33 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  59.59 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  59 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.82 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  58.88 
 
 		 340 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.05 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  59.05 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.51 
 
 		 337 aa  358  6e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.18 
 
 		 340 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.88 
 
 		 340 aa  350  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  55.92 
 
 		 337 aa  348  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.28 
 
 		 337 aa  345  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.76 
 
 		 337 aa  342  7e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  55.62 
 
 		 339 aa  338  7e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.1 
 
 		 339 aa  337  2.9999999999999997e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  53.08 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  50.88 
 
 		 343 aa  330  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  54.81 
 
 		 337 aa  323  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.2 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  53.76 
 
 		 346 aa  315  9e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  53.2 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.41 
 
 		 351 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  49.28 
 
 		 350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.34 
 
 		 346 aa  302  6.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  49.71 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.95 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.18 
 
 		 337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.27 
 
 		 345 aa  253  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  43.28 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.59 
 
 		 347 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.33 
 
 		 347 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.26 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.18 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.86 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 343 aa  175  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  30.51 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.86 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  35.22 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.52 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.36 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.67 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  36.39 
 
 		 336 aa  169  7e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.49 
 
 		 351 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.11 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  27.78 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.65 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  27.78 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.59 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 342 aa  162  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.06 
 
 		 345 aa  162  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.97 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  27.84 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.32 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  31.04 
 
 		 360 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  30.81 
 
 		 342 aa  159  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  29.5 
 
 		 339 aa  159  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  30.79 
 
 		 370 aa  159  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.1 
 
 		 353 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.1 
 
 		 353 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.82 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.49 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.37 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.94 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.47 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.32 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.5 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.18 
 
 		 348 aa  153  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.22 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.19 
 
 		 354 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.79 
 
 		 365 aa  152  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.69 
 
 		 348 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.62 
 
 		 354 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  32.49 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 351 aa  149  8e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  31.67 
 
 		 343 aa  149  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  31.42 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.49 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.72 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.34 
 
 		 350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 355 aa  146  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.38 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.3 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  30.92 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.75 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.02 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4017  heat-inducible transcription repressor  30.9 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  32.59 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  26.88 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  32.24 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  31.62 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>