242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2127 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 373 aa  732    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.41 
 
 		 352 aa  281  9e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  42.86 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  42.23 
 
 		 348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.11 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.98 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.08 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.29 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.58 
 
 		 347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.5 
 
 		 343 aa  216  7e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.84 
 
 		 345 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.39 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.55 
 
 		 343 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.92 
 
 		 343 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.97 
 
 		 343 aa  205  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.77 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.39 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.66 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.82 
 
 		 344 aa  201  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.88 
 
 		 343 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.26 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  31.62 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  32.75 
 
 		 338 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.65 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.97 
 
 		 344 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  32.46 
 
 		 338 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 348 aa  195  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  35.92 
 
 		 352 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.24 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  32.74 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  32.74 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  32.74 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  32.74 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  32.74 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.06 
 
 		 343 aa  192  8e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  32.27 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  32.27 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.91 
 
 		 343 aa  189  7e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.36 
 
 		 351 aa  189  9e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  30.42 
 
 		 343 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  33.62 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.33 
 
 		 354 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.72 
 
 		 348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.26 
 
 		 351 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  33.04 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.42 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.99 
 
 		 344 aa  179  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0007  heat-inducible transcription repressor  34.56 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.215417  normal  0.108375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  37.32 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.55 
 
 		 359 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0007  heat-inducible transcription repressor  34.84 
 
 		 362 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.55 
 
 		 359 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  36.1 
 
 		 367 aa  177  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.27 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  33.82 
 
 		 339 aa  176  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  34.5 
 
 		 342 aa  176  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  38.01 
 
 		 351 aa  175  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  34.18 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  37.13 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.23 
 
 		 337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.94 
 
 		 340 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.05 
 
 		 337 aa  173  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  36 
 
 		 340 aa  173  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  34.1 
 
 		 349 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.65 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2944  heat-inducible transcription repressor  35.04 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.67 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0181  heat-inducible transcription repressor  34.84 
 
 		 372 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.05 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0172  heat-inducible transcription repressor  34.84 
 
 		 374 aa  169  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0011  heat-inducible transcription repressor  33.52 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185452 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0398  heat-inducible transcription repressor  33.61 
 
 		 360 aa  169  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0166  heat-inducible transcription repressor  35.31 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0467  heat-inducible transcription repressor  36.8 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  35.31 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.84 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  29.39 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  35.78 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  29.39 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  35.78 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  35.78 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  32.87 
 
 		 336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0432  heat-inducible transcription repressor  35.23 
 
 		 363 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0399  heat-inducible transcription repressor  35.23 
 
 		 363 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.62 
 
 		 355 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.61 
 
 		 340 aa  166  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  35.65 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  32.57 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.01 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.01 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  35 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  34.4 
 
 		 340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  34.41 
 
 		 349 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  36.55 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>