251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0443 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 		 372 aa  748    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.51 
 
 		 345 aa  420  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.03 
 
 		 346 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.05 
 
 		 340 aa  278  8e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  44.57 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.17 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  44.05 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.63 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.09 
 
 		 341 aa  272  8.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.78 
 
 		 340 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  44.44 
 
 		 337 aa  269  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.92 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.55 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  41.26 
 
 		 340 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  41.89 
 
 		 351 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  43.09 
 
 		 343 aa  263  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  43.78 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.95 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.25 
 
 		 344 aa  259  6e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.85 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.14 
 
 		 340 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.53 
 
 		 340 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  40.61 
 
 		 343 aa  255  7e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  42.39 
 
 		 341 aa  255  8e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  41.26 
 
 		 340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.28 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  41.73 
 
 		 339 aa  249  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  42.2 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  40.65 
 
 		 343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.18 
 
 		 340 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  41.16 
 
 		 343 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  41.13 
 
 		 347 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  41.13 
 
 		 347 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  41.13 
 
 		 347 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.62 
 
 		 350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  39.95 
 
 		 343 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.71 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.85 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  29.57 
 
 		 344 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  26.34 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  33.11 
 
 		 339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  32.79 
 
 		 339 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.33 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.46 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.75 
 
 		 343 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.07 
 
 		 348 aa  162  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.38 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.61 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.49 
 
 		 343 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.75 
 
 		 344 aa  159  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.79 
 
 		 347 aa  159  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.54 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.88 
 
 		 354 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.11 
 
 		 343 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.9 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.01 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.88 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  26.76 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  26.76 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.27 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.01 
 
 		 357 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.56 
 
 		 359 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  26.76 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.11 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.04 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  26.76 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  26.76 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.32 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  30.83 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.98 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.01 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  26.76 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  26.76 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  27.03 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  27.03 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  26.76 
 
 		 338 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.87 
 
 		 363 aa  149  8e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.5 
 
 		 357 aa  149  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.24 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  25.82 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  29.84 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  29.78 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.83 
 
 		 342 aa  146  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.84 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.2 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.69 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.4 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  31.88 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  27.69 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  32.25 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  30.03 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  30.35 
 
 		 336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.71 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.14 
 
 		 341 aa  136  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  29.66 
 
 		 357 aa  135  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  28.91 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.94 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.51 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  30.69 
 
 		 353 aa  133  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.26 
 
 		 342 aa  133  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>