250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2164 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 355 aa  706    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.46 
 
 		 355 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.68 
 
 		 354 aa  345  6e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.86 
 
 		 342 aa  279  6e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.91 
 
 		 338 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.25 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.04 
 
 		 343 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.03 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.76 
 
 		 348 aa  222  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.68 
 
 		 351 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.82 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  34 
 
 		 344 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  34.58 
 
 		 339 aa  206  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.33 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  34.07 
 
 		 352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  35.38 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.49 
 
 		 343 aa  199  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.21 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  34.99 
 
 		 349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.17 
 
 		 351 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.64 
 
 		 348 aa  196  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  34.59 
 
 		 349 aa  196  8.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  33.52 
 
 		 352 aa  195  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  33.62 
 
 		 352 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  33.52 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  34.55 
 
 		 341 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  33.52 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  34.18 
 
 		 342 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.65 
 
 		 357 aa  189  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.62 
 
 		 347 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  35.45 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  32.56 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.01 
 
 		 343 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  32.42 
 
 		 352 aa  186  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  31.56 
 
 		 348 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  35.08 
 
 		 342 aa  185  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  32.47 
 
 		 337 aa  185  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  32.3 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2032  heat-inducible transcription repressor  34.47 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.69 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  32.57 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  32.1 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  32.1 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  32.1 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  32.1 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  32.1 
 
 		 340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  32.1 
 
 		 385 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  32.1 
 
 		 385 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  32.09 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  32.29 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.97 
 
 		 344 aa  182  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.55 
 
 		 344 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  32.39 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  32.1 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0166  heat-inducible transcription repressor  35.51 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.714476  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  34.4 
 
 		 343 aa  180  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  32.57 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  32 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.77 
 
 		 340 aa  179  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.77 
 
 		 340 aa  179  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  31.82 
 
 		 340 aa  179  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  32.39 
 
 		 340 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  33.91 
 
 		 355 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  32.39 
 
 		 340 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  30 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  32.39 
 
 		 340 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  31.99 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0970  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.56 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477518  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  30 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  32.1 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  32.1 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.47 
 
 		 351 aa  176  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1598  heat-inducible transcription repressor  36.26 
 
 		 354 aa  176  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.951274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  32.19 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  33.8 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  32.39 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  33.62 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 352 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  34.63 
 
 		 362 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.84 
 
 		 345 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  34.07 
 
 		 362 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  32 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  29.75 
 
 		 342 aa  169  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.38 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  34.08 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  33.52 
 
 		 362 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.56 
 
 		 357 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3005  heat-inducible transcription repressor  33.8 
 
 		 359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  32.01 
 
 		 339 aa  165  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0394  heat-inducible transcription repressor  33.52 
 
 		 362 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  28.37 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  26.4 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  32.77 
 
 		 367 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  32.02 
 
 		 354 aa  163  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.14 
 
 		 341 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0467  heat-inducible transcription repressor  33.05 
 
 		 370 aa  162  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  32.77 
 
 		 367 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.56 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>