248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2060 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
344 aa  689    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.17 
 
 
347 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  53.2 
 
 
343 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.46 
 
 
345 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.61 
 
 
345 aa  309  5e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  45.95 
 
 
344 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.59 
 
 
343 aa  275  9e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.07 
 
 
351 aa  270  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.7 
 
 
348 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.41 
 
 
343 aa  264  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  37.39 
 
 
343 aa  252  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.09 
 
 
341 aa  251  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  35.5 
 
 
338 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.44 
 
 
347 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  35.21 
 
 
338 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  34.91 
 
 
338 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  34.91 
 
 
338 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  34.6 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  34.91 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  34.91 
 
 
338 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  34.91 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  38.71 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  38.71 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  35.21 
 
 
338 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  34.91 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  34.91 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  35.48 
 
 
344 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.55 
 
 
343 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.1 
 
 
343 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.01 
 
 
344 aa  232  7.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.8 
 
 
343 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.22 
 
 
343 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.51 
 
 
344 aa  222  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.8 
 
 
342 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.3 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.13 
 
 
357 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.14 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.01 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.5 
 
 
343 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  32.75 
 
 
350 aa  211  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.12 
 
 
343 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.95 
 
 
340 aa  209  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.53 
 
 
342 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  35.65 
 
 
351 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  32.66 
 
 
352 aa  203  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  34.97 
 
 
340 aa  202  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.43 
 
 
350 aa  202  7e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  34.9 
 
 
343 aa  202  9e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.84 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.21 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.2 
 
 
339 aa  200  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  33.91 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.29 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.8 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  35.29 
 
 
337 aa  196  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  32.58 
 
 
364 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  36.15 
 
 
343 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.66 
 
 
352 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.59 
 
 
337 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  33.94 
 
 
347 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  35.48 
 
 
339 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  33.94 
 
 
347 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  33.94 
 
 
347 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.63 
 
 
351 aa  192  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  34.35 
 
 
336 aa  192  6e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  33.95 
 
 
343 aa  192  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  34 
 
 
367 aa  192  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  32.21 
 
 
360 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  32.21 
 
 
360 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0166  heat-inducible transcription repressor  34.88 
 
 
358 aa  192  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.714476  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  34.37 
 
 
343 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  35.28 
 
 
341 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.21 
 
 
340 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  33.84 
 
 
343 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.9 
 
 
341 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  32.6 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.36 
 
 
350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  35.08 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  31.18 
 
 
343 aa  189  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.42 
 
 
344 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2534  heat-inducible transcription repressor  34.29 
 
 
366 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 
365 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.02 
 
 
337 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.81 
 
 
365 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.36 
 
 
346 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.36 
 
 
355 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.83 
 
 
344 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.82 
 
 
373 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 
367 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  32.2 
 
 
339 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 
342 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.82 
 
 
357 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  33.14 
 
 
367 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.18 
 
 
353 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.18 
 
 
353 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0620  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.44 
 
 
337 aa  186  7e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000107992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.51 
 
 
346 aa  185  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.35 
 
 
350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.36 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.56 
 
 
359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>