247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0704 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 
350 aa  710    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  47.03 
 
 
352 aa  317  2e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1349  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.69 
 
 
341 aa  279  5e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0115435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  37.94 
 
 
338 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  37.94 
 
 
338 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  37.94 
 
 
338 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  38.15 
 
 
343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  37.94 
 
 
338 aa  246  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  37.94 
 
 
338 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  37.94 
 
 
338 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  37.94 
 
 
338 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  37.65 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  37.35 
 
 
338 aa  242  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  37.06 
 
 
338 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  35.92 
 
 
344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  36.31 
 
 
344 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.75 
 
 
344 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.56 
 
 
344 aa  199  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.46 
 
 
343 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.17 
 
 
344 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.58 
 
 
347 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.26 
 
 
345 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1025  heat-inducible transcription repressor  30.35 
 
 
347 aa  187  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000723404  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.94 
 
 
341 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0095  heat-inducible transcription repressor  31.79 
 
 
344 aa  181  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.57 
 
 
348 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.61 
 
 
343 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0161  heat-inducible transcription repressor  28.9 
 
 
360 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00204123  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.78 
 
 
351 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.79 
 
 
343 aa  170  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.32 
 
 
343 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.68 
 
 
345 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.52 
 
 
343 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  29.51 
 
 
339 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.55 
 
 
340 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.68 
 
 
351 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.9 
 
 
351 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  29.23 
 
 
339 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.83 
 
 
343 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.79 
 
 
347 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.24 
 
 
343 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  31.47 
 
 
340 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  31.47 
 
 
340 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  31.47 
 
 
340 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.81 
 
 
344 aa  157  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.07 
 
 
342 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.04 
 
 
350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.95 
 
 
345 aa  156  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  30.65 
 
 
340 aa  156  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0763  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.55 
 
 
336 aa  155  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.94526  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  30.51 
 
 
354 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.91 
 
 
343 aa  155  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0367  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.29 
 
 
340 aa  154  2e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.37 
 
 
341 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.65 
 
 
350 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.65 
 
 
348 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  30.88 
 
 
340 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  30.88 
 
 
340 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl417  heat inducible transcription repressor  30.88 
 
 
342 aa  153  5e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  30.36 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  30.36 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  30.36 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  30.36 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  30.36 
 
 
340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  30.36 
 
 
385 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  30.36 
 
 
385 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  30.88 
 
 
340 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.71 
 
 
357 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  30.06 
 
 
339 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  30.06 
 
 
339 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  30.84 
 
 
342 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  32.06 
 
 
342 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  30.27 
 
 
339 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.55 
 
 
350 aa  150  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1674  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.75 
 
 
325 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1640  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.75 
 
 
325 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.407829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  28.99 
 
 
339 aa  149  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  32.27 
 
 
336 aa  149  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.59 
 
 
337 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  30.21 
 
 
367 aa  149  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  31.55 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0970  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.39 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477518  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.06 
 
 
340 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.06 
 
 
340 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  29.59 
 
 
342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  29.59 
 
 
349 aa  146  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  29 
 
 
339 aa  146  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  30.24 
 
 
342 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1183  heat-inducible transcription repressor  28.78 
 
 
345 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556143  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.74 
 
 
337 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  30.15 
 
 
334 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  30.03 
 
 
336 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  30.14 
 
 
337 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  30.95 
 
 
337 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  30.15 
 
 
334 aa  143  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  30.61 
 
 
341 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_002936  DET1401  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.49 
 
 
345 aa  142  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.24 
 
 
354 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  29.22 
 
 
343 aa  142  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  31.38 
 
 
334 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>