250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1581 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 341 aa  692    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.12 
 
 		 345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.97 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.86 
 
 		 345 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.12 
 
 		 344 aa  269  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.09 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.05 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.53 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.47 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.46 
 
 		 347 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.35 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.12 
 
 		 343 aa  232  8.000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  34.35 
 
 		 344 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  34.64 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.03 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.57 
 
 		 345 aa  222  8e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  33.92 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  33.92 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  33.92 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  33.63 
 
 		 338 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  33.63 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  33.63 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  33.63 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  33.63 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  33.63 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  36.76 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  33.14 
 
 		 343 aa  215  8e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  36.47 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.23 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.31 
 
 		 357 aa  212  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.11 
 
 		 348 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.55 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.84 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 340 aa  195  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.74 
 
 		 344 aa  192  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.63 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.66 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.06 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.53 
 
 		 343 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.75 
 
 		 351 aa  189  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.25 
 
 		 343 aa  189  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.1 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  31.38 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  32.27 
 
 		 340 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  31.27 
 
 		 339 aa  186  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  35.49 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  32.12 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  31.94 
 
 		 350 aa  184  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.86 
 
 		 343 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 		 353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  31.67 
 
 		 360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.29 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  30 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  30.29 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.59 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.63 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  31.01 
 
 		 341 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  31.68 
 
 		 364 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  32.47 
 
 		 339 aa  179  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  30.56 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  30.56 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  31.75 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  31.75 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  31.75 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.13 
 
 		 351 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.09 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  31.12 
 
 		 337 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.4 
 
 		 357 aa  176  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  31.12 
 
 		 343 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.5 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.9 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  31.14 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  31.18 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  30.97 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  30.58 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  29.82 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  30.59 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  32.02 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.75 
 
 		 350 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  32.02 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.03 
 
 		 359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.44 
 
 		 339 aa  173  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  32.02 
 
 		 340 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  32.02 
 
 		 340 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  32.02 
 
 		 340 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  32.63 
 
 		 340 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  32.63 
 
 		 340 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  32.63 
 
 		 340 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  32.63 
 
 		 340 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  32.63 
 
 		 340 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  31.75 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  32.63 
 
 		 385 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  32.63 
 
 		 385 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0620  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.84 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000107992  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.42 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.38 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.88 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  31.72 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>