250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2210 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 340 aa  651    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  66.48 
 
 		 351 aa  411  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  67.75 
 
 		 341 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  61.18 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  60.77 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  65.22 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.99 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  59.17 
 
 		 337 aa  368  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  58.58 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.06 
 
 		 337 aa  363  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  60.47 
 
 		 339 aa  363  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.67 
 
 		 346 aa  358  8e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.43 
 
 		 340 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  55.62 
 
 		 343 aa  353  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  58.89 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.82 
 
 		 337 aa  352  7e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  55.75 
 
 		 341 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.68 
 
 		 340 aa  341  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  55.1 
 
 		 339 aa  339  4e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  55.59 
 
 		 339 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.51 
 
 		 340 aa  338  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  55.19 
 
 		 340 aa  335  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.05 
 
 		 340 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  55.19 
 
 		 351 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  53.41 
 
 		 340 aa  332  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  53.49 
 
 		 344 aa  327  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  53.04 
 
 		 347 aa  318  6e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  53.04 
 
 		 347 aa  318  6e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  53.04 
 
 		 347 aa  318  6e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.93 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  52.06 
 
 		 343 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.65 
 
 		 350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  51.61 
 
 		 343 aa  310  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  50.59 
 
 		 343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  49.71 
 
 		 344 aa  295  5e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  50.45 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  45.31 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.55 
 
 		 345 aa  258  9e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.75 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.63 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.41 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.12 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.55 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.84 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.74 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  30.99 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  29.97 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  36.45 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.29 
 
 		 357 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.29 
 
 		 345 aa  179  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.62 
 
 		 343 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  34.52 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  29.68 
 
 		 344 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.95 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.22 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.2 
 
 		 345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.66 
 
 		 351 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.57 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.86 
 
 		 343 aa  172  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.08 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  35.07 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  30.99 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.95 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  37.46 
 
 		 367 aa  169  9e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.25 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.56 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  27.09 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  30.55 
 
 		 350 aa  167  4e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.81 
 
 		 345 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.53 
 
 		 348 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.79 
 
 		 341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  34.68 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  34.99 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.53 
 
 		 344 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  34.5 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  34.11 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  34.01 
 
 		 336 aa  162  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  34.49 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  34.78 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  29.53 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  31.53 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  34.11 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  34.32 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  30.11 
 
 		 360 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  30.11 
 
 		 360 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  31.69 
 
 		 342 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.56 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  36.09 
 
 		 355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  33.63 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.81 
 
 		 359 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  34.94 
 
 		 354 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  32.66 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  27.59 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.05 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  25.89 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.75 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  32.27 
 
 		 339 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.9 
 
 		 359 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.34 
 
 		 350 aa  149  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>