249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0820 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 
352 aa  714    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  47.03 
 
 
350 aa  317  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  39.83 
 
 
344 aa  258  9e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  41.76 
 
 
338 aa  250  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  41.48 
 
 
338 aa  248  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  40.8 
 
 
338 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  40.8 
 
 
338 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  40.8 
 
 
338 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  40.52 
 
 
338 aa  246  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  41.19 
 
 
338 aa  246  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  41.19 
 
 
338 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  41.19 
 
 
338 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  41.19 
 
 
338 aa  246  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1349  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.03 
 
 
341 aa  243  3e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0115435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  39.49 
 
 
343 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  38.4 
 
 
344 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.66 
 
 
344 aa  203  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.81 
 
 
347 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.44 
 
 
344 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.98 
 
 
344 aa  186  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.55 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.26 
 
 
351 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.21 
 
 
343 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.19 
 
 
345 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.4 
 
 
343 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.98 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.26 
 
 
345 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.46 
 
 
343 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.2 
 
 
341 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1025  heat-inducible transcription repressor  29.43 
 
 
347 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000723404  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.9 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.9 
 
 
359 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  29.8 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  29.48 
 
 
339 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.19 
 
 
343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.35 
 
 
357 aa  160  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.83 
 
 
343 aa  159  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.34 
 
 
342 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0367  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.07 
 
 
340 aa  158  1e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0095  heat-inducible transcription repressor  30.68 
 
 
344 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.34 
 
 
344 aa  155  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.15 
 
 
345 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.59 
 
 
351 aa  152  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.13 
 
 
343 aa  152  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.09 
 
 
376 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  28.77 
 
 
364 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.41 
 
 
348 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.22 
 
 
343 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.41 
 
 
342 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1168  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.27 
 
 
337 aa  150  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.45 
 
 
350 aa  149  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.66 
 
 
347 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  31.03 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0161  heat-inducible transcription repressor  27.86 
 
 
360 aa  146  5e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00204123  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.51 
 
 
354 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  28.83 
 
 
343 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  28.37 
 
 
353 aa  142  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  28.12 
 
 
349 aa  142  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.96 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.42 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.96 
 
 
343 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.12 
 
 
344 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  28.82 
 
 
339 aa  139  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0763  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.81 
 
 
336 aa  139  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.94526  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  27.22 
 
 
349 aa  139  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  28.78 
 
 
341 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl417  heat inducible transcription repressor  30.3 
 
 
342 aa  139  7.999999999999999e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  29.75 
 
 
334 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.61 
 
 
353 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.29 
 
 
355 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  26.93 
 
 
349 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.61 
 
 
353 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  27.63 
 
 
343 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  29.28 
 
 
337 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.35 
 
 
351 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  29.97 
 
 
360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  29.97 
 
 
360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  27.35 
 
 
343 aa  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.54 
 
 
352 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  28.24 
 
 
347 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  27.11 
 
 
336 aa  136  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  28.24 
 
 
347 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  28.24 
 
 
347 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  28.77 
 
 
336 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0620  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.27 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000107992  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  29.33 
 
 
360 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  29.19 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  29.04 
 
 
342 aa  134  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  27.93 
 
 
351 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0970  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.95 
 
 
350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  29.14 
 
 
334 aa  133  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.5 
 
 
337 aa  133  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  27.51 
 
 
365 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  28.41 
 
 
334 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  28.69 
 
 
334 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  26.76 
 
 
342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.2 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.18 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  26.8 
 
 
357 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  26.81 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>