249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4390 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 359 aa  729    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  93.73 
 
 		 359 aa  675    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.36 
 
 		 376 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.03 
 
 		 354 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1183  heat-inducible transcription repressor  40 
 
 		 345 aa  250  3e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556143  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1401  heat-inducible transcription repressor HrcA  40 
 
 		 345 aa  246  6e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1210  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.84 
 
 		 345 aa  245  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297014  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.67 
 
 		 344 aa  245  8e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.95 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.73 
 
 		 351 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.62 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.37 
 
 		 343 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  30.7 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.17 
 
 		 348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.69 
 
 		 343 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  29.86 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.56 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.61 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.26 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.67 
 
 		 337 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.74 
 
 		 343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.31 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.19 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.05 
 
 		 351 aa  182  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 		 343 aa  182  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  34.58 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.7 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.17 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.26 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.64 
 
 		 348 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.03 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  33.71 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.53 
 
 		 337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 340 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.01 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.81 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.06 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  33.72 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  29.68 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.94 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  33.62 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.53 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  28.86 
 
 		 342 aa  169  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.91 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  29.15 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.26 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  28.78 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  28.9 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  29.15 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  29.28 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  28.78 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.05 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.83 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  28.99 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  28.99 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.56 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  32.65 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  28.86 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  28.86 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  28.86 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  30.57 
 
 		 339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  32.65 
 
 		 339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  28.86 
 
 		 338 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  28.86 
 
 		 338 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  31.96 
 
 		 336 aa  162  9e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.56 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.05 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  32.08 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.01 
 
 		 354 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.08 
 
 		 351 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.25 
 
 		 353 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.25 
 
 		 353 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  30.46 
 
 		 348 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  32.29 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.12 
 
 		 344 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.53 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.29 
 
 		 355 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.44 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  31.21 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  31.5 
 
 		 342 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.69 
 
 		 357 aa  157  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  32.14 
 
 		 362 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.19 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.31 
 
 		 357 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  29.17 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.33 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  32.22 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.47 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  32.61 
 
 		 362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  31.52 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.89 
 
 		 354 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.45 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  30 
 
 		 349 aa  152  8e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  30.56 
 
 		 372 aa  152  8.999999999999999e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  31.96 
 
 		 362 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>