244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1661 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 
365 aa  741    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  84.38 
 
 
365 aa  613  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  61.33 
 
 
370 aa  453  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  59.3 
 
 
364 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  56.83 
 
 
360 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  54.7 
 
 
360 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  54.7 
 
 
360 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  52.02 
 
 
353 aa  344  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.04 
 
 
343 aa  203  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.23 
 
 
347 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.27 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.61 
 
 
343 aa  196  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.06 
 
 
347 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.96 
 
 
344 aa  190  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.06 
 
 
345 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.13 
 
 
341 aa  188  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.08 
 
 
344 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.45 
 
 
351 aa  187  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  31 
 
 
343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  32.33 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  35.87 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.2 
 
 
343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  35.12 
 
 
351 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.13 
 
 
345 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.78 
 
 
344 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  30.14 
 
 
344 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 
337 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.23 
 
 
348 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  33.61 
 
 
339 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.52 
 
 
337 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.48 
 
 
339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.01 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  33.42 
 
 
343 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.16 
 
 
344 aa  172  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.3 
 
 
355 aa  172  9e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  33.61 
 
 
343 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  32.97 
 
 
343 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.65 
 
 
357 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  33.06 
 
 
339 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 
347 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 
347 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26961  negative regulator of class I heat shock protein  33.05 
 
 
352 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 
347 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  32.87 
 
 
336 aa  170  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  27.98 
 
 
339 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.75 
 
 
343 aa  170  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  31.02 
 
 
336 aa  170  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.04 
 
 
351 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.7 
 
 
340 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  27.98 
 
 
339 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.54 
 
 
352 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.12 
 
 
337 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  30.2 
 
 
338 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  29.32 
 
 
342 aa  168  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  30.2 
 
 
338 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  30.2 
 
 
338 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  29.91 
 
 
338 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  29.91 
 
 
338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  29.91 
 
 
338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  29.91 
 
 
338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  29.91 
 
 
338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  29.91 
 
 
338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.09 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.98 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.15 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.65 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  32 
 
 
348 aa  164  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  29.01 
 
 
343 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  31.81 
 
 
357 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2417  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.41 
 
 
324 aa  163  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  31.4 
 
 
343 aa  163  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  29.63 
 
 
338 aa  162  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  30 
 
 
350 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.59 
 
 
342 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.33 
 
 
344 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.88 
 
 
357 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.48 
 
 
343 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  32.87 
 
 
340 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  30.49 
 
 
341 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.34 
 
 
343 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  32.3 
 
 
337 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  30.6 
 
 
352 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.83 
 
 
348 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.87 
 
 
350 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2097  negative regulator of class I heat shock protein  34.17 
 
 
324 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  31.69 
 
 
367 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.91 
 
 
346 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  33.42 
 
 
343 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.98 
 
 
343 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.58 
 
 
346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.56 
 
 
340 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1598  heat-inducible transcription repressor  31.32 
 
 
354 aa  156  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.951274  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  31.71 
 
 
367 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1183  heat-inducible transcription repressor  32.15 
 
 
345 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556143  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  29.23 
 
 
349 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.05 
 
 
341 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  28.93 
 
 
349 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  29.86 
 
 
349 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>