250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3224 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
345 aa  695    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  60 
 
 
347 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.46 
 
 
344 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  48.55 
 
 
343 aa  335  5.999999999999999e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  46.51 
 
 
344 aa  332  8e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.94 
 
 
345 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.18 
 
 
343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.86 
 
 
341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.88 
 
 
343 aa  279  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.92 
 
 
351 aa  265  8e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.51 
 
 
348 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  41.12 
 
 
339 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  40.83 
 
 
339 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  36.98 
 
 
338 aa  262  8e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  37.28 
 
 
338 aa  259  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  37.57 
 
 
338 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  36.98 
 
 
338 aa  258  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  36.98 
 
 
338 aa  258  8e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  36.98 
 
 
338 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  36.98 
 
 
338 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  36.98 
 
 
338 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  36.98 
 
 
338 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  36.98 
 
 
338 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  37.9 
 
 
343 aa  256  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  35.28 
 
 
344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.09 
 
 
343 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.26 
 
 
347 aa  250  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.68 
 
 
343 aa  246  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  35.4 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.42 
 
 
345 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.95 
 
 
357 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.9 
 
 
344 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.65 
 
 
343 aa  236  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.22 
 
 
343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.5 
 
 
343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.69 
 
 
342 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.31 
 
 
348 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.87 
 
 
343 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.58 
 
 
343 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  34.54 
 
 
364 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  35.17 
 
 
351 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  35.55 
 
 
340 aa  215  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.22 
 
 
340 aa  215  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.86 
 
 
344 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.01 
 
 
339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  34.93 
 
 
360 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.76 
 
 
342 aa  210  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  35.29 
 
 
337 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  32.65 
 
 
339 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 
337 aa  206  7e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  33.03 
 
 
347 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  33.03 
 
 
347 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  33.03 
 
 
347 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.65 
 
 
344 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  33.13 
 
 
343 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  35.48 
 
 
336 aa  202  6e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 
337 aa  202  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  33.23 
 
 
343 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.13 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  33.9 
 
 
360 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  33.9 
 
 
360 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  33.96 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.32 
 
 
337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 
370 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  34.1 
 
 
353 aa  199  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  32.13 
 
 
343 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  33.14 
 
 
339 aa  198  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.45 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.26 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  32.29 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 
352 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 
340 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  31.76 
 
 
343 aa  195  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.26 
 
 
359 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  32.75 
 
 
352 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  33.14 
 
 
339 aa  193  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.76 
 
 
350 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.91 
 
 
355 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.56 
 
 
351 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 
365 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.82 
 
 
341 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.09 
 
 
357 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.04 
 
 
344 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.18 
 
 
344 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.81 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 
373 aa  190  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  32.51 
 
 
339 aa  190  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0620  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.24 
 
 
337 aa  190  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000107992  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  32.18 
 
 
348 aa  189  5e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3244  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.85 
 
 
347 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  32.11 
 
 
357 aa  188  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.65 
 
 
351 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  32.34 
 
 
337 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.8 
 
 
353 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.8 
 
 
353 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.52 
 
 
357 aa  186  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  33.53 
 
 
337 aa  186  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  32 
 
 
365 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  33.92 
 
 
334 aa  186  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.7 
 
 
350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>