250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3534 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 343 aa  696    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  82.01 
 
 		 342 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  71.14 
 
 		 343 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  66.76 
 
 		 343 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  66.18 
 
 		 343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.48 
 
 		 343 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.47 
 
 		 344 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  50.58 
 
 		 357 aa  359  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  45.75 
 
 		 348 aa  325  5e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.19 
 
 		 354 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  45 
 
 		 351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.25 
 
 		 357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.6 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.98 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.28 
 
 		 353 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.28 
 
 		 353 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  41.42 
 
 		 349 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  41.72 
 
 		 349 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.77 
 
 		 351 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1598  heat-inducible transcription repressor  42.47 
 
 		 354 aa  271  8.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.951274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  42.01 
 
 		 349 aa  270  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  42.14 
 
 		 334 aa  270  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0970  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.79 
 
 		 350 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  40.95 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  40.24 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  40 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.12 
 
 		 342 aa  263  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  41.64 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  41.64 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  41.54 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  41.64 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  41.64 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  41.64 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  41.64 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  41.64 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  38.94 
 
 		 339 aa  259  6e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  40.76 
 
 		 338 aa  259  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.35 
 
 		 350 aa  258  8e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.57 
 
 		 347 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  40.99 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  41.06 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  41.06 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  40.83 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  41.06 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  40.95 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  41.06 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  41.06 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  41.06 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  41.09 
 
 		 342 aa  255  9e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  40.58 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  40.65 
 
 		 334 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  40.76 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  41.06 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  41.06 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  40.58 
 
 		 341 aa  252  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  37.54 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  38.57 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  40.36 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  39.36 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  40.59 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  40.59 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  40.47 
 
 		 367 aa  249  5e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.17 
 
 		 345 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.09 
 
 		 345 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  39.94 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2944  heat-inducible transcription repressor  39.65 
 
 		 372 aa  242  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  40.64 
 
 		 355 aa  242  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  38.51 
 
 		 354 aa  242  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  39.94 
 
 		 362 aa  242  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  39.65 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0166  heat-inducible transcription repressor  39.13 
 
 		 358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.714476  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  37.57 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.18 
 
 		 340 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.18 
 
 		 340 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.9 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  36.5 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0394  heat-inducible transcription repressor  40.68 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.5 
 
 		 354 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  38.48 
 
 		 362 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0467  heat-inducible transcription repressor  38.95 
 
 		 370 aa  235  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0432  heat-inducible transcription repressor  38.95 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  39.02 
 
 		 367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0399  heat-inducible transcription repressor  38.95 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  38.18 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  38.19 
 
 		 362 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.34 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.1 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1266  heat-inducible transcription repressor  38.08 
 
 		 366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0103094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2032  heat-inducible transcription repressor  39.17 
 
 		 339 aa  233  5e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.25 
 
 		 355 aa  232  6e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  37.71 
 
 		 367 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  37.28 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  37.89 
 
 		 352 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  37.9 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4017  heat-inducible transcription repressor  38.15 
 
 		 356 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0007  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  37.61 
 
 		 352 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2324  heat-inducible transcription repressor  37.96 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528523 
 
 
-
 
NC_004310  BR0172  heat-inducible transcription repressor  37.79 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2534  heat-inducible transcription repressor  37.61 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>