248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1168 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1168  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
337 aa  658    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.8 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  33.63 
 
 
339 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 
339 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
348 aa  186  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.46 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.97 
 
 
351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.55 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.85 
 
 
343 aa  179  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.02 
 
 
345 aa  177  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.37 
 
 
344 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  30.65 
 
 
344 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  30.09 
 
 
344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.53 
 
 
345 aa  170  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.18 
 
 
344 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.36 
 
 
347 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  27.4 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.34 
 
 
343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  27.56 
 
 
351 aa  165  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.06 
 
 
337 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  29.41 
 
 
339 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.12 
 
 
339 aa  161  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.25 
 
 
344 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  29.2 
 
 
338 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  28.92 
 
 
338 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  28.61 
 
 
338 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  28.61 
 
 
338 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.17 
 
 
343 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  28.61 
 
 
338 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  28.61 
 
 
338 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  28.61 
 
 
338 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  28.31 
 
 
338 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  28.96 
 
 
338 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.45 
 
 
345 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  28.19 
 
 
343 aa  159  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  28.01 
 
 
338 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  29.25 
 
 
360 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.5 
 
 
343 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  27.46 
 
 
339 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  31.47 
 
 
342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.83 
 
 
341 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.38 
 
 
340 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.41 
 
 
343 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.99 
 
 
342 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  28.33 
 
 
364 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  29.03 
 
 
341 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.65 
 
 
350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.86 
 
 
354 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  28.57 
 
 
339 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  29.14 
 
 
370 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.65 
 
 
351 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  30.27 
 
 
352 aa  150  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  29.91 
 
 
342 aa  149  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  29.53 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  29.71 
 
 
339 aa  147  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.2 
 
 
350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0970  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.09 
 
 
350 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  26.2 
 
 
340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.7 
 
 
357 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  27.08 
 
 
337 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.57 
 
 
344 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.22 
 
 
343 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.4 
 
 
353 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.4 
 
 
353 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  30.51 
 
 
352 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.2 
 
 
343 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.19 
 
 
340 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.59 
 
 
365 aa  143  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  29.01 
 
 
360 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  27.25 
 
 
343 aa  143  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  29.01 
 
 
360 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  26.35 
 
 
353 aa  143  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.49 
 
 
351 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.22 
 
 
337 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.51 
 
 
340 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.57 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.03 
 
 
337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.06 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.65 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  29.5 
 
 
334 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.94 
 
 
340 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  27.35 
 
 
367 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  28.53 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.84 
 
 
344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.07 
 
 
359 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  26.84 
 
 
349 aa  139  6e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  28.78 
 
 
334 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.32 
 
 
337 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.27 
 
 
357 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  27.14 
 
 
349 aa  139  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.37 
 
 
343 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  27.27 
 
 
349 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  29.26 
 
 
352 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.73 
 
 
355 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.88 
 
 
341 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  27.92 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  29.86 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  26.47 
 
 
367 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.78 
 
 
346 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.36 
 
 
359 aa  136  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>