250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1264 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 
339 aa  664    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  85.84 
 
 
339 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  67.66 
 
 
341 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  64.29 
 
 
337 aa  427  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  64.97 
 
 
340 aa  427  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  65.58 
 
 
337 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  65.19 
 
 
340 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  65.19 
 
 
351 aa  421  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  61.18 
 
 
343 aa  408  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  61.54 
 
 
343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.43 
 
 
337 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.83 
 
 
340 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  61.68 
 
 
340 aa  398  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  61.95 
 
 
339 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  60.42 
 
 
343 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  61 
 
 
347 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  61 
 
 
347 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  61 
 
 
347 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  60.53 
 
 
343 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  60.24 
 
 
343 aa  391  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.46 
 
 
344 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.06 
 
 
340 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  59 
 
 
344 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.3 
 
 
340 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  61 
 
 
337 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  58.58 
 
 
337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.42 
 
 
339 aa  356  2.9999999999999997e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.72 
 
 
346 aa  355  5.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.75 
 
 
341 aa  348  7e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  57.73 
 
 
337 aa  347  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.98 
 
 
351 aa  347  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.38 
 
 
346 aa  345  6e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.57 
 
 
340 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.22 
 
 
337 aa  310  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  50.73 
 
 
350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  50.75 
 
 
336 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.29 
 
 
345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  43.51 
 
 
372 aa  262  6.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
347 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.29 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  32.13 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.04 
 
 
337 aa  196  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 
344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.56 
 
 
343 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  37.9 
 
 
336 aa  194  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.59 
 
 
342 aa  192  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.77 
 
 
343 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  32.22 
 
 
339 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.73 
 
 
344 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  32.22 
 
 
339 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 
345 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.5 
 
 
347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  34.2 
 
 
336 aa  182  9.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
343 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.99 
 
 
342 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.65 
 
 
343 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.04 
 
 
344 aa  180  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.41 
 
 
344 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.01 
 
 
351 aa  179  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.38 
 
 
343 aa  179  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.17 
 
 
357 aa  178  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.59 
 
 
345 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.02 
 
 
343 aa  175  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.92 
 
 
344 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.97 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  32.62 
 
 
370 aa  173  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.86 
 
 
348 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.88 
 
 
348 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  31.12 
 
 
339 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  30.59 
 
 
343 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.49 
 
 
345 aa  169  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.58 
 
 
357 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  28.21 
 
 
360 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 
359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.41 
 
 
363 aa  166  6.9999999999999995e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  30.86 
 
 
338 aa  166  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.82 
 
 
343 aa  165  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  31.17 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  30.86 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  30.56 
 
 
338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  30.56 
 
 
338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  30.56 
 
 
338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.53 
 
 
343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.85 
 
 
359 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  30.56 
 
 
338 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  30.56 
 
 
338 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  30.56 
 
 
338 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.08 
 
 
354 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.05 
 
 
351 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  34.02 
 
 
355 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  30.25 
 
 
338 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.48 
 
 
365 aa  159  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  30.09 
 
 
342 aa  159  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.2 
 
 
353 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.2 
 
 
353 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  32.14 
 
 
365 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.59 
 
 
355 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  33.04 
 
 
348 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.37 
 
 
350 aa  157  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  31.87 
 
 
364 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>