251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1643 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 340 aa  664    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  68.55 
 
 		 337 aa  441  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  67.06 
 
 		 340 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  64.48 
 
 		 341 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  64.12 
 
 		 340 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  64.22 
 
 		 340 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  63.93 
 
 		 351 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  64.52 
 
 		 339 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  62.09 
 
 		 339 aa  408  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.35 
 
 		 340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  62.99 
 
 		 343 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  61.49 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  62.72 
 
 		 343 aa  404  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.91 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  61.36 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  59 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  60.98 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  59.82 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  59.82 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  59.82 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.95 
 
 		 340 aa  381  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  58.93 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.05 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  58.16 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  57.77 
 
 		 343 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.06 
 
 		 351 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.87 
 
 		 346 aa  368  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  57.44 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.35 
 
 		 341 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.18 
 
 		 346 aa  348  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.52 
 
 		 339 aa  347  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  57.27 
 
 		 337 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.51 
 
 		 340 aa  342  5.999999999999999e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.84 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.06 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.34 
 
 		 336 aa  301  8.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.42 
 
 		 345 aa  262  6.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  44.14 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.95 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.72 
 
 		 343 aa  205  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  38.39 
 
 		 336 aa  202  9e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.06 
 
 		 347 aa  198  9e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.72 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.01 
 
 		 344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.86 
 
 		 344 aa  196  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.88 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  32.84 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  32.84 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  32.25 
 
 		 344 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.23 
 
 		 342 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  32.94 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.03 
 
 		 343 aa  186  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.74 
 
 		 343 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.17 
 
 		 348 aa  186  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.94 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.54 
 
 		 357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.36 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.9 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.95 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.24 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.27 
 
 		 353 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.27 
 
 		 353 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.42 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  34.04 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.56 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  32.04 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  29.73 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  31.63 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.45 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  30.82 
 
 		 343 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.41 
 
 		 345 aa  172  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  34.02 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  30.72 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.74 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  30.72 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  30.72 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  31.02 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  30.56 
 
 		 370 aa  169  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  30.54 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  30.24 
 
 		 338 aa  168  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  30.72 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  30.72 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  30.72 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.03 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.75 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.29 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  35.59 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  32.61 
 
 		 365 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  33.96 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1168  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.38 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  30.06 
 
 		 342 aa  163  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  34.71 
 
 		 352 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.72 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.72 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.23 
 
 		 351 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>