250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3163 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 344 aa  676    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  73.26 
 
 		 344 aa  501  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  67.14 
 
 		 347 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  67.14 
 
 		 347 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  67.14 
 
 		 347 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  67.34 
 
 		 343 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  66.47 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  65.9 
 
 		 343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  64.04 
 
 		 341 aa  438  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  62.57 
 
 		 340 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  57.4 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  58.46 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  58.82 
 
 		 340 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  60.23 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  59 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  58.82 
 
 		 351 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.53 
 
 		 340 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.77 
 
 		 340 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.11 
 
 		 337 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.33 
 
 		 337 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  56.05 
 
 		 339 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.07 
 
 		 337 aa  351  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  54.71 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  52.07 
 
 		 343 aa  344  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  52.94 
 
 		 343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  53.2 
 
 		 339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.3 
 
 		 346 aa  330  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.23 
 
 		 341 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.2 
 
 		 340 aa  322  8e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  51.92 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  51.46 
 
 		 337 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.42 
 
 		 351 aa  315  8e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.16 
 
 		 346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  48.84 
 
 		 350 aa  309  5.9999999999999995e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  50.15 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  46.78 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.47 
 
 		 345 aa  262  4.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  42.25 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.96 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.65 
 
 		 345 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.32 
 
 		 343 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.8 
 
 		 343 aa  189  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.42 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.1 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.71 
 
 		 347 aa  185  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.41 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.41 
 
 		 343 aa  182  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.5 
 
 		 351 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.36 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  35.69 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  29.65 
 
 		 339 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  29.65 
 
 		 339 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  29.82 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.32 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.11 
 
 		 357 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.52 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.56 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  33.13 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  29.59 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.52 
 
 		 345 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.78 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.98 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.85 
 
 		 343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  27.93 
 
 		 344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  33.6 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.79 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.55 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  32.6 
 
 		 360 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.1 
 
 		 376 aa  162  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.03 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.07 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.06 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  28.65 
 
 		 342 aa  159  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.69 
 
 		 351 aa  159  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  33.53 
 
 		 352 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.1 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.35 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.19 
 
 		 353 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.19 
 
 		 353 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 365 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.1 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.4 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.13 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  31.15 
 
 		 370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  33.52 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  29.97 
 
 		 343 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  30.9 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 		 365 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.82 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  29.53 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  31.78 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.84 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  29.21 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  29.21 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  28.82 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.55 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.82 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  30.9 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  31.2 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>