250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2192 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 346 aa  665    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  72.3 
 
 		 341 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  64.39 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  65.22 
 
 		 340 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.72 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  58.48 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  57.6 
 
 		 343 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  58.38 
 
 		 339 aa  361  8e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.55 
 
 		 337 aa  361  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  58.26 
 
 		 339 aa  358  9e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  57.51 
 
 		 340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.1 
 
 		 337 aa  355  3.9999999999999996e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.52 
 
 		 340 aa  354  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  57.23 
 
 		 351 aa  354  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  58.43 
 
 		 339 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.68 
 
 		 337 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.09 
 
 		 346 aa  348  7e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  56.98 
 
 		 337 aa  346  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.31 
 
 		 340 aa  345  8e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.39 
 
 		 340 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  56.45 
 
 		 347 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  56.45 
 
 		 347 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  56.45 
 
 		 347 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  54.81 
 
 		 340 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  55.81 
 
 		 337 aa  337  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  55.78 
 
 		 337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  55.98 
 
 		 341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  56.23 
 
 		 343 aa  333  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.27 
 
 		 340 aa  332  8e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  55.07 
 
 		 343 aa  332  8e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  55.07 
 
 		 343 aa  329  4e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.99 
 
 		 350 aa  323  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.16 
 
 		 344 aa  322  7e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.34 
 
 		 344 aa  315  7e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.52 
 
 		 337 aa  309  5.9999999999999995e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  49.56 
 
 		 336 aa  292  5e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  46.76 
 
 		 372 aa  289  4e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.94 
 
 		 345 aa  263  2e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.29 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.76 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  33.82 
 
 		 344 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.41 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  35.48 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.64 
 
 		 343 aa  189  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  31.79 
 
 		 344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.98 
 
 		 337 aa  182  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.65 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.72 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  37.46 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  34.1 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.09 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.82 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  33.14 
 
 		 342 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.02 
 
 		 348 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.17 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.92 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  30.81 
 
 		 339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  30.25 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.75 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.71 
 
 		 351 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 		 343 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.18 
 
 		 343 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.26 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.69 
 
 		 343 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.86 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.91 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  36.71 
 
 		 352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 360 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.53 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 359 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.68 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  32.32 
 
 		 360 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  32.32 
 
 		 360 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  35 
 
 		 350 aa  159  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  35.53 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  32.77 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  32 
 
 		 370 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  28.9 
 
 		 343 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  37.86 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0166  heat-inducible transcription repressor  34.77 
 
 		 358 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.714476  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.72 
 
 		 343 aa  156  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  35.54 
 
 		 353 aa  155  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  34.46 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.34 
 
 		 365 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.03 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  36.31 
 
 		 355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  34.27 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.84 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  36.18 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.48 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  35.88 
 
 		 334 aa  153  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.06 
 
 		 345 aa  152  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.49 
 
 		 363 aa  152  8.999999999999999e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  27.75 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  32.6 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  34.76 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  27.87 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.99 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  27.87 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>