250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_17300 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 336 aa  659    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  50.9 
 
 		 337 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  50.89 
 
 		 343 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.44 
 
 		 351 aa  310  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.34 
 
 		 340 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.34 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  51.8 
 
 		 337 aa  301  9e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  49.41 
 
 		 340 aa  299  5e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  50.74 
 
 		 340 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  50.75 
 
 		 339 aa  295  7e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  50.45 
 
 		 337 aa  295  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  46.78 
 
 		 344 aa  294  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.95 
 
 		 344 aa  293  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  48.81 
 
 		 351 aa  292  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  50.45 
 
 		 340 aa  292  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  48.36 
 
 		 343 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  50.6 
 
 		 337 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  48.66 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.71 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  47.2 
 
 		 341 aa  289  4e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.16 
 
 		 337 aa  285  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  45.99 
 
 		 340 aa  286  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  48.35 
 
 		 339 aa  286  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  49.56 
 
 		 346 aa  286  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.16 
 
 		 340 aa  285  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  49.56 
 
 		 346 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  49.56 
 
 		 341 aa  282  7.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  45.65 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  44.35 
 
 		 347 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  44.35 
 
 		 347 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  44.35 
 
 		 347 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  43.99 
 
 		 343 aa  265  7e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  43.47 
 
 		 343 aa  265  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.43 
 
 		 340 aa  265  8.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  43.4 
 
 		 343 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.54 
 
 		 350 aa  252  7e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  37.96 
 
 		 372 aa  225  7e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.32 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.56 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.72 
 
 		 347 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 345 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  34.66 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.63 
 
 		 344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  33.84 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.08 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.56 
 
 		 343 aa  159  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.94 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.91 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.15 
 
 		 345 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.24 
 
 		 348 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.5 
 
 		 354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  27.27 
 
 		 344 aa  156  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.49 
 
 		 343 aa  155  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.36 
 
 		 343 aa  155  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  28.77 
 
 		 339 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  28.77 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.39 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.12 
 
 		 343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  33.52 
 
 		 370 aa  153  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.46 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.56 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  31.9 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  31.65 
 
 		 360 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.07 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  30.18 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.15 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  33.9 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  32.86 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  33.71 
 
 		 353 aa  143  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.98 
 
 		 345 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.66 
 
 		 348 aa  142  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.65 
 
 		 350 aa  142  8e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  26.79 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  32.76 
 
 		 362 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.21 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.49 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  29.23 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  29.88 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.23 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.18 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.18 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0394  heat-inducible transcription repressor  31.9 
 
 		 362 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.78 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  27.08 
 
 		 338 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.63 
 
 		 357 aa  136  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  25.89 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4017  heat-inducible transcription repressor  31.83 
 
 		 356 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.09 
 
 		 343 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.53 
 
 		 342 aa  135  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  27.08 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  31.66 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.52 
 
 		 344 aa  135  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  27.63 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  30.97 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0763  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.3 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.94526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.97 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.666448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>