243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0394 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  92.27 
 
 		 362 aa  672    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  90.03 
 
 		 362 aa  659    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  97.24 
 
 		 362 aa  699    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  91.99 
 
 		 362 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0394  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 		 362 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  90.88 
 
 		 362 aa  665    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  87.57 
 
 		 362 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2534  heat-inducible transcription repressor  71.47 
 
 		 366 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1266  heat-inducible transcription repressor  66.19 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0103094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2324  heat-inducible transcription repressor  66.47 
 
 		 364 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2944  heat-inducible transcription repressor  65.71 
 
 		 372 aa  463  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  67.54 
 
 		 367 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  66.96 
 
 		 367 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0432  heat-inducible transcription repressor  64.45 
 
 		 363 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0467  heat-inducible transcription repressor  64.45 
 
 		 370 aa  448  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0399  heat-inducible transcription repressor  64.45 
 
 		 363 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_004310  BR0172  heat-inducible transcription repressor  63.29 
 
 		 374 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0166  heat-inducible transcription repressor  63.29 
 
 		 374 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0181  heat-inducible transcription repressor  63.01 
 
 		 372 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4017  heat-inducible transcription repressor  60.46 
 
 		 356 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  59.49 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0007  heat-inducible transcription repressor  59.25 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387776 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0398  heat-inducible transcription repressor  59.94 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0007  heat-inducible transcription repressor  59.25 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.215417  normal  0.108375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0011  heat-inducible transcription repressor  58.89 
 
 		 359 aa  403  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185452 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  56.07 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0166  heat-inducible transcription repressor  55.77 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.714476  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3005  heat-inducible transcription repressor  53.11 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  53.06 
 
 		 367 aa  349  3e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  52.19 
 
 		 355 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0009  heat-inducible transcription repressor  52.45 
 
 		 351 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2657  heat-inducible transcription repressor  49.28 
 
 		 350 aa  328  8e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44913  normal  0.911216 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2873  heat-inducible transcription repressor  49.43 
 
 		 354 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0207  heat-inducible transcription repressor  48.7 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3464  heat-inducible transcription repressor  50.14 
 
 		 354 aa  322  5e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0253  heat-inducible transcription repressor  52.6 
 
 		 347 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.261487 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1220  heat-inducible transcription repressor  47.83 
 
 		 356 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2881  heat-inducible transcription repressor  47.95 
 
 		 346 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0566  heat-inducible transcription repressor  51.73 
 
 		 342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.360767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2060  heat-inducible transcription repressor  48.73 
 
 		 354 aa  278  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  42.44 
 
 		 340 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  42.44 
 
 		 340 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  41.98 
 
 		 340 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  41.98 
 
 		 340 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  42.44 
 
 		 340 aa  245  9e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  41.98 
 
 		 340 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  42.2 
 
 		 342 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  40 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.68 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  39.36 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  38.89 
 
 		 336 aa  237  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  39.71 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  40.94 
 
 		 334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  39.71 
 
 		 339 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  40.82 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  39.94 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  39.94 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  38.55 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  39.94 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  39.94 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  39.94 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  39.94 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  39.94 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  39.66 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.74 
 
 		 351 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  40.41 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  39.53 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  38.68 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.48 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.79 
 
 		 342 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  38.78 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  38.05 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  36.71 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  38.29 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  40.06 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  40 
 
 		 350 aa  223  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  37.25 
 
 		 352 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  36.9 
 
 		 352 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.94 
 
 		 351 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  38.95 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  38.11 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  37.18 
 
 		 352 aa  222  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.08 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.08 
 
 		 343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  39.83 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  37.61 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.32 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2032  heat-inducible transcription repressor  38.48 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  38.89 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.03 
 
 		 350 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 		 349 aa  218  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.63 
 
 		 357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 		 349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  39.08 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  37.17 
 
 		 343 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  37.68 
 
 		 334 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  38 
 
 		 357 aa  210  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  37.9 
 
 		 342 aa  209  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0970  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.43 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477518  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.08 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>