248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2060 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2060  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 		 354 aa  693    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0253  heat-inducible transcription repressor  64.16 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.261487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0566  heat-inducible transcription repressor  61.88 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.360767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2534  heat-inducible transcription repressor  51.58 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2944  heat-inducible transcription repressor  52.15 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0172  heat-inducible transcription repressor  48.84 
 
 		 374 aa  323  4e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  50 
 
 		 362 aa  322  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0166  heat-inducible transcription repressor  48.84 
 
 		 374 aa  322  7e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1266  heat-inducible transcription repressor  49.71 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0103094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3005  heat-inducible transcription repressor  50.29 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  48.44 
 
 		 362 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  49.29 
 
 		 362 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  48.16 
 
 		 362 aa  318  6e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0166  heat-inducible transcription repressor  49.28 
 
 		 358 aa  319  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.714476  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  49.29 
 
 		 362 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  50.57 
 
 		 367 aa  318  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0181  heat-inducible transcription repressor  47.69 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  48.31 
 
 		 362 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0394  heat-inducible transcription repressor  48.73 
 
 		 362 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2324  heat-inducible transcription repressor  48.7 
 
 		 364 aa  316  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  50 
 
 		 367 aa  315  8e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4017  heat-inducible transcription repressor  48.17 
 
 		 356 aa  315  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  48.57 
 
 		 354 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  45.64 
 
 		 352 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0467  heat-inducible transcription repressor  49.57 
 
 		 370 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0399  heat-inducible transcription repressor  49.29 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0007  heat-inducible transcription repressor  47.23 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.215417  normal  0.108375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0432  heat-inducible transcription repressor  49.29 
 
 		 363 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0398  heat-inducible transcription repressor  48.26 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0007  heat-inducible transcription repressor  47.23 
 
 		 362 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0011  heat-inducible transcription repressor  46.65 
 
 		 359 aa  305  6e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185452 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3464  heat-inducible transcription repressor  46.55 
 
 		 354 aa  296  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  47.21 
 
 		 367 aa  293  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0009  heat-inducible transcription repressor  48.83 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2873  heat-inducible transcription repressor  44.61 
 
 		 354 aa  288  9e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2657  heat-inducible transcription repressor  45.56 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44913  normal  0.911216 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1220  heat-inducible transcription repressor  45.27 
 
 		 356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2881  heat-inducible transcription repressor  45.38 
 
 		 346 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0207  heat-inducible transcription repressor  44.35 
 
 		 354 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.625753 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  44.87 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  37.03 
 
 		 340 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  37.03 
 
 		 340 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  37.03 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  37.03 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  37.03 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  37.03 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.66 
 
 		 351 aa  222  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.64 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  35.09 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  36.71 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  36.44 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  36.44 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  36.44 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  36.44 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  36.44 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  36.44 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  36.44 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  38.87 
 
 		 342 aa  219  7e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  37.76 
 
 		 343 aa  219  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.12 
 
 		 353 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.12 
 
 		 353 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.55 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  36.31 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  36.96 
 
 		 349 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.32 
 
 		 354 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  34.69 
 
 		 339 aa  215  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  36.42 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  36.13 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.17 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  35.47 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1598  heat-inducible transcription repressor  39.23 
 
 		 354 aa  209  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.951274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  35.85 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.82 
 
 		 344 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  36.07 
 
 		 349 aa  206  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  35.57 
 
 		 352 aa  205  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  34.83 
 
 		 352 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2032  heat-inducible transcription repressor  38.71 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.24 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.69 
 
 		 350 aa  204  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  37.43 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  33.13 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.82 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.9 
 
 		 343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.05 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.05 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  36.83 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  36.04 
 
 		 337 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  32.54 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.6 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.53 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  36.09 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  35.21 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  33.05 
 
 		 348 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.62 
 
 		 348 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.34 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0970  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.42 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477518  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.94 
 
 		 357 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.89 
 
 		 351 aa  194  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  34.6 
 
 		 342 aa  193  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>