251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1858 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
350 aa  709    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  52.57 
 
 
349 aa  355  7.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  53.51 
 
 
351 aa  345  8.999999999999999e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  48.97 
 
 
350 aa  324  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0970  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.34 
 
 
350 aa  322  6e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477518  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  49.11 
 
 
351 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  45.91 
 
 
339 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  45.27 
 
 
349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  45.56 
 
 
349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  47.52 
 
 
342 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  46.15 
 
 
343 aa  301  9e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  45.69 
 
 
345 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1598  heat-inducible transcription repressor  48.24 
 
 
354 aa  294  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.951274  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2032  heat-inducible transcription repressor  50.44 
 
 
339 aa  293  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  45.03 
 
 
341 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  45.51 
 
 
352 aa  292  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  46.8 
 
 
339 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  47.09 
 
 
339 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  45.22 
 
 
352 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  46.51 
 
 
339 aa  288  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  45.61 
 
 
342 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  47.08 
 
 
334 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  47.08 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  45.64 
 
 
340 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  44.44 
 
 
348 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  45.64 
 
 
340 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  45.64 
 
 
340 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  45.64 
 
 
340 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  45.64 
 
 
340 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  45.64 
 
 
340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  46.8 
 
 
340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  46.29 
 
 
342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  44.94 
 
 
352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  39.41 
 
 
342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  46.51 
 
 
340 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  46.51 
 
 
340 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  45.91 
 
 
334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  46.51 
 
 
340 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  46.51 
 
 
340 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  46.51 
 
 
340 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  45.32 
 
 
336 aa  282  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  46.22 
 
 
385 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  46.22 
 
 
385 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  45.59 
 
 
339 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.95 
 
 
340 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.95 
 
 
340 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  44.71 
 
 
334 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  43.24 
 
 
336 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  43.24 
 
 
336 aa  279  6e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  45.61 
 
 
334 aa  278  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  46.33 
 
 
338 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  45.32 
 
 
334 aa  276  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  44.87 
 
 
337 aa  275  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.35 
 
 
343 aa  258  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.31 
 
 
342 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.64 
 
 
344 aa  256  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.83 
 
 
343 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.47 
 
 
343 aa  245  8e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.56 
 
 
357 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0398  heat-inducible transcription repressor  40.23 
 
 
360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  41.21 
 
 
355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  39.55 
 
 
354 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.19 
 
 
343 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  41.67 
 
 
367 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.06 
 
 
343 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  38.19 
 
 
352 aa  230  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.29 
 
 
354 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4017  heat-inducible transcription repressor  40.11 
 
 
356 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  39.19 
 
 
362 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0011  heat-inducible transcription repressor  38.3 
 
 
359 aa  225  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185452 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  38.7 
 
 
362 aa  223  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.43 
 
 
355 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  39.26 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0007  heat-inducible transcription repressor  38.48 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387776 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0009  heat-inducible transcription repressor  39.38 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341671  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.22 
 
 
353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.22 
 
 
353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.96 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_004310  BR0172  heat-inducible transcription repressor  39.53 
 
 
374 aa  220  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  39.37 
 
 
362 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0166  heat-inducible transcription repressor  39.53 
 
 
374 aa  219  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3005  heat-inducible transcription repressor  38.24 
 
 
359 aa  219  7e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0007  heat-inducible transcription repressor  38.19 
 
 
362 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.215417  normal  0.108375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  37.75 
 
 
367 aa  219  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3464  heat-inducible transcription repressor  38.29 
 
 
354 aa  218  7.999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0166  heat-inducible transcription repressor  38.79 
 
 
358 aa  219  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.714476  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  38.24 
 
 
362 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0394  heat-inducible transcription repressor  39.03 
 
 
362 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0399  heat-inducible transcription repressor  37.36 
 
 
363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  37.75 
 
 
367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0432  heat-inducible transcription repressor  37.36 
 
 
363 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  38.18 
 
 
362 aa  216  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0181  heat-inducible transcription repressor  38.66 
 
 
372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2657  heat-inducible transcription repressor  38.46 
 
 
350 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44913  normal  0.911216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2944  heat-inducible transcription repressor  37.68 
 
 
372 aa  215  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2324  heat-inducible transcription repressor  38.68 
 
 
364 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2534  heat-inducible transcription repressor  37.36 
 
 
366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0467  heat-inducible transcription repressor  36.78 
 
 
370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.11 
 
 
345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0566  heat-inducible transcription repressor  39.76 
 
 
342 aa  212  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.360767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>