248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11690 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
350 aa  688    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  51.16 
 
 
341 aa  332  6e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  54.68 
 
 
343 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.29 
 
 
346 aa  322  5e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  50.59 
 
 
343 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.21 
 
 
351 aa  319  6e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  52.49 
 
 
337 aa  318  7.999999999999999e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  51.59 
 
 
339 aa  316  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  53.24 
 
 
340 aa  316  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  50.58 
 
 
337 aa  312  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.31 
 
 
337 aa  311  9e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  50.73 
 
 
337 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  51.73 
 
 
337 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  49.86 
 
 
343 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  50.73 
 
 
339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  52.63 
 
 
351 aa  309  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  49.57 
 
 
347 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  49.57 
 
 
347 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  49.57 
 
 
347 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  48.84 
 
 
344 aa  309  5.9999999999999995e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  51.91 
 
 
340 aa  308  8e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  48.7 
 
 
343 aa  306  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.65 
 
 
340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  49.28 
 
 
344 aa  306  5.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.99 
 
 
346 aa  301  8.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.9 
 
 
340 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  48.4 
 
 
340 aa  298  7e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  48.26 
 
 
340 aa  298  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  49.85 
 
 
337 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.26 
 
 
341 aa  296  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.06 
 
 
340 aa  295  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  49.57 
 
 
339 aa  295  6e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  48.12 
 
 
343 aa  295  9e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  49.42 
 
 
339 aa  291  9e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.48 
 
 
337 aa  271  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.54 
 
 
336 aa  246  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.41 
 
 
345 aa  239  4e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  39.62 
 
 
372 aa  233  5e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.43 
 
 
344 aa  202  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.01 
 
 
347 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  30.86 
 
 
344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  36.04 
 
 
336 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  31.79 
 
 
344 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.5 
 
 
343 aa  186  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.38 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.55 
 
 
343 aa  179  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.64 
 
 
343 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 
342 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.88 
 
 
345 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.73 
 
 
337 aa  175  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.91 
 
 
343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.28 
 
 
344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.12 
 
 
345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.98 
 
 
343 aa  169  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  31.69 
 
 
339 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.15 
 
 
343 aa  166  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.19 
 
 
351 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  36.7 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.86 
 
 
348 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  35.5 
 
 
354 aa  163  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  28.61 
 
 
343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.83 
 
 
351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.65 
 
 
347 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
352 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.75 
 
 
343 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  33.81 
 
 
336 aa  161  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.66 
 
 
348 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.88 
 
 
365 aa  160  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  29.91 
 
 
338 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
343 aa  159  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.52 
 
 
357 aa  159  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  29.91 
 
 
338 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  29.61 
 
 
338 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.24 
 
 
357 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.56 
 
 
343 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  29.61 
 
 
338 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  35.35 
 
 
341 aa  156  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  29.61 
 
 
338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  29.61 
 
 
338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  29.61 
 
 
338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.76 
 
 
350 aa  156  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  29.61 
 
 
338 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  29.61 
 
 
338 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.03 
 
 
350 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.27 
 
 
343 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  29.61 
 
 
338 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  27.71 
 
 
339 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  33.05 
 
 
357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.78 
 
 
344 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  27.71 
 
 
339 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 
336 aa  152  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  32.27 
 
 
348 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  33.52 
 
 
342 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  34.38 
 
 
362 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  29.55 
 
 
350 aa  150  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  34.1 
 
 
338 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  30.09 
 
 
342 aa  149  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  34.02 
 
 
337 aa  149  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.06 
 
 
350 aa  149  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>