249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13430 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 341 aa  668    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  72.3 
 
 		 346 aa  431  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  67.95 
 
 		 340 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  65.62 
 
 		 351 aa  418  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.5 
 
 		 339 aa  408  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  61.9 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  61.31 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  61.72 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  58.75 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.35 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  58.51 
 
 		 343 aa  364  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  57.57 
 
 		 339 aa  364  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.81 
 
 		 337 aa  364  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  59.29 
 
 		 340 aa  363  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.35 
 
 		 340 aa  361  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  58.58 
 
 		 351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  57.65 
 
 		 341 aa  355  5.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.69 
 
 		 340 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  59.48 
 
 		 346 aa  353  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  56.38 
 
 		 337 aa  352  4e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  56.08 
 
 		 337 aa  350  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  58.04 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  59.17 
 
 		 337 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  55.49 
 
 		 340 aa  347  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  55.78 
 
 		 347 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  55.78 
 
 		 347 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  55.78 
 
 		 347 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.97 
 
 		 340 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.23 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  54.52 
 
 		 343 aa  333  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  54.68 
 
 		 343 aa  333  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.2 
 
 		 344 aa  332  5e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  53.51 
 
 		 343 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.26 
 
 		 350 aa  315  6e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.06 
 
 		 337 aa  309  4e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  49.56 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  44.09 
 
 		 372 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  45.59 
 
 		 345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.01 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.9 
 
 		 344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.82 
 
 		 345 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.06 
 
 		 343 aa  192  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.19 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.42 
 
 		 344 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.35 
 
 		 343 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.55 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.16 
 
 		 337 aa  186  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.38 
 
 		 343 aa  185  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.82 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.14 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.12 
 
 		 348 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  35.01 
 
 		 339 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  30.41 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.59 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  36.18 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  30.41 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  32.04 
 
 		 344 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.91 
 
 		 343 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.39 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.63 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.68 
 
 		 343 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.53 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  31.44 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  34.93 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  37.06 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.53 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.61 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  36.58 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.28 
 
 		 357 aa  172  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  36.18 
 
 		 336 aa  172  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.36 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  36.07 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  36.26 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  39.54 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  35.8 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  31.58 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  33.98 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  35.47 
 
 		 342 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  33.14 
 
 		 348 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 348 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  36.36 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  34.21 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  34.3 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  34.9 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.33 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.33 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  35.86 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  35.86 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  35.86 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  35.86 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  35.86 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  35.86 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.63 
 
 		 359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  35.86 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  35.86 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  35.86 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.91 
 
 		 354 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  36.15 
 
 		 340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  36.15 
 
 		 340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  36.15 
 
 		 340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>