250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1874 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
357 aa  721    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  78.37 
 
 
357 aa  566  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  77.31 
 
 
350 aa  555  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  73.95 
 
 
357 aa  528  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  68.63 
 
 
348 aa  496  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  65.83 
 
 
355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  65.63 
 
 
352 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.29 
 
 
373 aa  248  9e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.3 
 
 
345 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.78 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.1 
 
 
347 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.29 
 
 
344 aa  195  8.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.2 
 
 
357 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.48 
 
 
342 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.58 
 
 
348 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.68 
 
 
354 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.09 
 
 
342 aa  186  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.49 
 
 
343 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.58 
 
 
344 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  30.31 
 
 
344 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.15 
 
 
343 aa  186  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.05 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.48 
 
 
343 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.09 
 
 
345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.64 
 
 
348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.92 
 
 
343 aa  182  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.01 
 
 
347 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.28 
 
 
344 aa  179  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  29.49 
 
 
344 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.95 
 
 
363 aa  177  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.34 
 
 
351 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.4 
 
 
341 aa  176  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.75 
 
 
344 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  30.99 
 
 
338 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  30.99 
 
 
338 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  30.99 
 
 
338 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  30.99 
 
 
338 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.8 
 
 
343 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  30.99 
 
 
338 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  30.99 
 
 
338 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.62 
 
 
343 aa  170  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  30.99 
 
 
338 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  30.7 
 
 
338 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  30.03 
 
 
343 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  30.41 
 
 
338 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  30.7 
 
 
338 aa  169  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.56 
 
 
355 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  32.44 
 
 
364 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  30.97 
 
 
339 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  30.97 
 
 
339 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.05 
 
 
359 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  29.44 
 
 
348 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.8 
 
 
354 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.17 
 
 
351 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  29.86 
 
 
352 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  30.14 
 
 
352 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  30.88 
 
 
339 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.56 
 
 
345 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.62 
 
 
351 aa  157  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.05 
 
 
350 aa  157  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.49 
 
 
343 aa  156  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.13 
 
 
359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  30.4 
 
 
343 aa  156  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  27.35 
 
 
339 aa  156  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  29.3 
 
 
342 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  30.34 
 
 
340 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  31.46 
 
 
334 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  28.45 
 
 
345 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  27.35 
 
 
339 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  30.25 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  30.25 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  30.48 
 
 
352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  29.32 
 
 
352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  30.25 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  30.25 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  30.25 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  30.25 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  30.25 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  32.53 
 
 
343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  30.59 
 
 
340 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  30.59 
 
 
340 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  30.25 
 
 
340 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  30.59 
 
 
340 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  30.59 
 
 
340 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  30.59 
 
 
340 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.94 
 
 
338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  30.31 
 
 
340 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.06 
 
 
355 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  32.4 
 
 
362 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.99 
 
 
337 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  31.07 
 
 
334 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  27.84 
 
 
339 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.41 
 
 
343 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  28.73 
 
 
342 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.93 
 
 
353 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  30.03 
 
 
339 aa  150  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  32.49 
 
 
362 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.93 
 
 
353 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  30.13 
 
 
370 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.09 
 
 
355 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>