250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1693 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 357 aa  720    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  78.37 
 
 		 357 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  73.86 
 
 		 350 aa  536  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  72.47 
 
 		 357 aa  526  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  71.19 
 
 		 348 aa  508  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  66.57 
 
 		 355 aa  473  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  64.57 
 
 		 352 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.08 
 
 		 373 aa  249  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.56 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.8 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.44 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.05 
 
 		 343 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.49 
 
 		 344 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.2 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.02 
 
 		 344 aa  182  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  30.4 
 
 		 344 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.11 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 342 aa  180  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.64 
 
 		 348 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.11 
 
 		 343 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.79 
 
 		 342 aa  179  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.23 
 
 		 363 aa  179  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.06 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  29.69 
 
 		 344 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.52 
 
 		 345 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.61 
 
 		 351 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  32.8 
 
 		 364 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.99 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.2 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.99 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.48 
 
 		 347 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.59 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  33.62 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  29.49 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  31.56 
 
 		 342 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.34 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  29.86 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  29.21 
 
 		 339 aa  162  9e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  29.6 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  31.65 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.58 
 
 		 354 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.23 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  31.09 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  29.57 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  29.86 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  32.1 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.82 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  32.1 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  29.21 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  32.1 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  29.6 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  31.25 
 
 		 345 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  29.6 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  29.6 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  29.6 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  29.6 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  29.6 
 
 		 338 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  31.11 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.18 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  31.65 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.41 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  30.81 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.69 
 
 		 359 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.27 
 
 		 351 aa  157  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  30.86 
 
 		 352 aa  156  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  29.35 
 
 		 360 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  31.25 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  30.88 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.52 
 
 		 365 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  29.23 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  31.71 
 
 		 334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.11 
 
 		 338 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.29 
 
 		 343 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.17 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  31.23 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  31.71 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.22 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  30.4 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.41 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.16 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  33.88 
 
 		 362 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  33.7 
 
 		 362 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  32.31 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  33.62 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3244  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.75 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal  0.0534413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>