247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1401 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1401  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 345 aa  709    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1183  heat-inducible transcription repressor  96.52 
 
 		 345 aa  686    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556143  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1210  heat-inducible transcription repressor HrcA  95.65 
 
 		 345 aa  674    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297014  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  40 
 
 		 359 aa  246  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.97 
 
 		 359 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.55 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.42 
 
 		 376 aa  216  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.86 
 
 		 351 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.51 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.21 
 
 		 344 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.63 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.67 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.14 
 
 		 343 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.19 
 
 		 343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.62 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.95 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.44 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.1 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.55 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.44 
 
 		 343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  32 
 
 		 338 aa  162  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  32 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.32 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  32 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  31.08 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.25 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  30.03 
 
 		 344 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.13 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  31.38 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  31.69 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  31.38 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.09 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.86 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.24 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  31.38 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.33 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  31.38 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  31.38 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  29.19 
 
 		 344 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  30.29 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.23 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.26 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.53 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  28.74 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  29.85 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.61 
 
 		 347 aa  152  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  30.21 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.3 
 
 		 373 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.21 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.35 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.23 
 
 		 340 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  29.59 
 
 		 340 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.23 
 
 		 340 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.7 
 
 		 341 aa  149  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  29.95 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  29.3 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  29.25 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  28.99 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.2 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  28.99 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  28.99 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  28.99 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  28.11 
 
 		 342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.61 
 
 		 357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.46 
 
 		 357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  28.99 
 
 		 385 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  28.99 
 
 		 385 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  28.99 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  28.99 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  28.99 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  30.79 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.92 
 
 		 365 aa  146  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  30.12 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.36 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  28.96 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.11 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.77 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  28.7 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  28.7 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  31.29 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  28.7 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.91 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.03 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  30.63 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.47 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  31.18 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  30.63 
 
 		 339 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  27.94 
 
 		 339 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  29.72 
 
 		 340 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  28.49 
 
 		 350 aa  142  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  29 
 
 		 336 aa  142  8e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.79 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.12 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  28.4 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  29.97 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  29.92 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  30.81 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  30.06 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  29.92 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>