251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1360 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1360  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
343 aa  685    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0763  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.32 
 
 
336 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.94526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  31.27 
 
 
344 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.31 
 
 
344 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.49 
 
 
345 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.25 
 
 
348 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  30.48 
 
 
343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.73 
 
 
343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  30.75 
 
 
344 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.25 
 
 
357 aa  149  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  29.97 
 
 
338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  29.97 
 
 
338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  30.37 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  30.37 
 
 
339 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  29.76 
 
 
338 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  29.76 
 
 
338 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  29.76 
 
 
338 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  29.76 
 
 
338 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.36 
 
 
343 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  29.76 
 
 
338 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  29.76 
 
 
338 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  29.76 
 
 
338 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.64 
 
 
348 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.01 
 
 
347 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  28.53 
 
 
345 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.56 
 
 
352 aa  142  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.57 
 
 
343 aa  142  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.06 
 
 
351 aa  142  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.86 
 
 
342 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.07 
 
 
344 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.17 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  26.51 
 
 
362 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  27.38 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  28.87 
 
 
338 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  28.13 
 
 
357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0398  heat-inducible transcription repressor  26.86 
 
 
360 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  27.01 
 
 
362 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.55 
 
 
357 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0166  heat-inducible transcription repressor  26.57 
 
 
374 aa  137  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  27.51 
 
 
362 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  26.8 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  26.72 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.94 
 
 
357 aa  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  25.93 
 
 
348 aa  136  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0394  heat-inducible transcription repressor  26.51 
 
 
362 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.9 
 
 
351 aa  136  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.15 
 
 
343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.91 
 
 
354 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  26.51 
 
 
362 aa  135  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  28.25 
 
 
348 aa  135  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0467  heat-inducible transcription repressor  28.16 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0172  heat-inducible transcription repressor  26.29 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.66 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  27.35 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.68 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  27.41 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.78 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.67 
 
 
350 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  26.7 
 
 
354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  28.12 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  26.67 
 
 
334 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2944  heat-inducible transcription repressor  28.45 
 
 
372 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.38 
 
 
343 aa  133  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0399  heat-inducible transcription repressor  27.87 
 
 
363 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  29.65 
 
 
334 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2534  heat-inducible transcription repressor  26.69 
 
 
366 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0181  heat-inducible transcription repressor  25.93 
 
 
372 aa  132  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.79 
 
 
357 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.42 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0007  heat-inducible transcription repressor  27.14 
 
 
362 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000387776 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  26.44 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0432  heat-inducible transcription repressor  27.87 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.63 
 
 
350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  27.56 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4017  heat-inducible transcription repressor  26.01 
 
 
356 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  24.21 
 
 
340 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0011  heat-inducible transcription repressor  27.38 
 
 
359 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000185452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.93 
 
 
337 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  24.21 
 
 
340 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.51 
 
 
343 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.05 
 
 
343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0007  heat-inducible transcription repressor  26.5 
 
 
362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.215417  normal  0.108375 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1266  heat-inducible transcription repressor  28.12 
 
 
366 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0103094 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.96 
 
 
376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  27.7 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  26.46 
 
 
352 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  23.51 
 
 
352 aa  129  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  26.8 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2324  heat-inducible transcription repressor  27.38 
 
 
364 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528523 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  24.79 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  26.18 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.72 
 
 
355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  26.21 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.12 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  27.12 
 
 
342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  25.14 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.61 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  25.83 
 
 
352 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  26.4 
 
 
334 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  25.65 
 
 
336 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>