205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0848 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0848  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 
264 aa  535  1e-151  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0773  heat-inducible transcription repressor  93.54 
 
 
263 aa  501  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.149257  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1260  heat-inducible transcription repressor  82.13 
 
 
240 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.775914  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0937  heat-inducible transcription repressor  57.03 
 
 
260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.156441  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1091  heat-inducible transcription repressor  46.36 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000108949  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1121  heat-inducible transcription repressor  46.92 
 
 
262 aa  236  2e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000692409  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2044  heat-inducible transcription repressor  46.74 
 
 
267 aa  236  4e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0514653  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0151  heat-inducible transcription repressor  44.15 
 
 
264 aa  229  5e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000619699  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1360  heat-inducible transcription repressor  34.19 
 
 
267 aa  154  9e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000135051  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1823  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.43 
 
 
335 aa  56.2  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.66 
 
 
357 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.29 
 
 
345 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.48 
 
 
354 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2097  negative regulator of class I heat shock protein  31.82 
 
 
324 aa  55.5  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  40.62 
 
 
339 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  40.62 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3244  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.57 
 
 
347 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  42.19 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.46 
 
 
350 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 
337 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  31.71 
 
 
338 aa  53.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  32.56 
 
 
343 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.37 
 
 
352 aa  52.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.06 
 
 
337 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 
334 aa  52  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 
334 aa  52  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.37 
 
 
351 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.76 
 
 
344 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.24 
 
 
340 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.37 
 
 
357 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  32.56 
 
 
343 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  40.62 
 
 
334 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  33.72 
 
 
343 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 
354 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  40.68 
 
 
343 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  32.56 
 
 
347 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  40.91 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.06 
 
 
337 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  40.91 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  32.56 
 
 
347 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.49 
 
 
355 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  32.56 
 
 
347 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  44.07 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  40.68 
 
 
339 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 
372 aa  50.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.06 
 
 
337 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.76 
 
 
340 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  36.51 
 
 
339 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  35.94 
 
 
337 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  30.28 
 
 
334 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.13 
 
 
344 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.39 
 
 
346 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1220  heat-inducible transcription repressor  24.86 
 
 
356 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  34.78 
 
 
341 aa  50.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  38.24 
 
 
360 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  40.62 
 
 
339 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0763  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.06 
 
 
336 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.94526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 
336 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.98 
 
 
340 aa  49.7  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.13 
 
 
336 aa  50.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2881  heat-inducible transcription repressor  24.86 
 
 
346 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.52 
 
 
347 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.5 
 
 
340 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  40.62 
 
 
339 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0172  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 
374 aa  49.3  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.47 
 
 
343 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0970  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.32 
 
 
350 aa  49.3  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477518  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  39.74 
 
 
357 aa  49.7  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  38.24 
 
 
348 aa  49.3  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  36.23 
 
 
343 aa  49.3  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  36.51 
 
 
339 aa  49.7  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  35.94 
 
 
341 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.77 
 
 
355 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.71 
 
 
341 aa  49.3  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.47 
 
 
343 aa  49.3  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  27.91 
 
 
342 aa  49.3  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  37.29 
 
 
340 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0166  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 
374 aa  49.3  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.68 
 
 
344 aa  49.3  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.06 
 
 
347 aa  49.3  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  39.06 
 
 
336 aa  49.3  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.94 
 
 
338 aa  48.9  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.15 
 
 
345 aa  48.9  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.76 
 
 
343 aa  48.9  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  38.24 
 
 
348 aa  48.9  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1025  heat-inducible transcription repressor  39.71 
 
 
347 aa  48.9  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000723404  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.88 
 
 
346 aa  48.9  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0673  heat-inducible transcription repressor  30.23 
 
 
392 aa  48.1  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.538731  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.68 
 
 
355 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1360  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.13 
 
 
343 aa  48.5  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.7 
 
 
345 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3005  heat-inducible transcription repressor  35.94 
 
 
359 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  30.95 
 
 
336 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  35.94 
 
 
342 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.07 
 
 
342 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.23 
 
 
345 aa  48.5  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0181  heat-inducible transcription repressor  36.25 
 
 
372 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  34.78 
 
 
340 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.31 
 
 
363 aa  47.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  37.29 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>