246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1360 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1360  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 		 267 aa  545  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000135051  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0151  heat-inducible transcription repressor  38.06 
 
 		 264 aa  185  8e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000619699  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1091  heat-inducible transcription repressor  37.74 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000108949  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1121  heat-inducible transcription repressor  35.85 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000692409  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0937  heat-inducible transcription repressor  36.57 
 
 		 260 aa  165  5e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.156441  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2044  heat-inducible transcription repressor  34.18 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0514653  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0848  heat-inducible transcription repressor  34.19 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0773  heat-inducible transcription repressor  33.82 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.149257  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1260  heat-inducible transcription repressor  30.15 
 
 		 240 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.775914  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.26 
 
 		 355 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0763  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.51 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.94526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.78 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  38.55 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.3 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3244  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.86 
 
 		 347 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  42.19 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.06 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  29.83 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  30 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.13 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.37 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.44 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.26 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  35.53 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.66 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.47 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.19 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.28 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.1 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.06 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.71 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1360  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.71 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1294  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.66 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.190693  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  40.28 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.24 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  40.28 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.26 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.14 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.26 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.18 
 
 		 340 aa  58.9  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.66 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  28.23 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  34.12 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.28 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  46.48 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.43 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.37 
 
 		 340 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.57 
 
 		 343 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  40.54 
 
 		 348 aa  57  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.97 
 
 		 343 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  42.86 
 
 		 344 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.33 
 
 		 343 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3005  heat-inducible transcription repressor  41.18 
 
 		 359 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.06 
 
 		 343 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.37 
 
 		 340 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  40.91 
 
 		 351 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.94 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.68 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1242  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.79 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0655276  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.26 
 
 		 351 aa  57  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  39.74 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.68 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  38.24 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  27.32 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.88 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  29.5 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.36 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  40.62 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  40.91 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.68 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.62 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0673  heat-inducible transcription repressor  42.11 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.538731  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1823  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.89 
 
 		 335 aa  55.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22958  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  25.77 
 
 		 357 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.47 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.68 
 
 		 341 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  38.98 
 
 		 339 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0253  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 		 347 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.261487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  38.98 
 
 		 339 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.67 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.36 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  30.93 
 
 		 340 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0566  heat-inducible transcription repressor  37.5 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.360767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.98 
 
 		 346 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  39.74 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.91 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  30.93 
 
 		 340 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  38.89 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  39.74 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.86 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  35.06 
 
 		 334 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  27.08 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  23.91 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  36.67 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  39.74 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  39.24 
 
 		 343 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.58 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  31.18 
 
 		 340 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  31.18 
 
 		 340 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1674  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.18 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>