250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1294 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1294  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 336 aa  655    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.190693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.91 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.07 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  28.7 
 
 		 339 aa  142  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.63 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.06 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.82 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  34.2 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  32.94 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  28.49 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  28.49 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  33.23 
 
 		 362 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  28.57 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.03 
 
 		 343 aa  136  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  35.56 
 
 		 367 aa  135  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  26.67 
 
 		 344 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.25 
 
 		 351 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.93 
 
 		 348 aa  133  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  33.63 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  30.96 
 
 		 342 aa  132  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0399  heat-inducible transcription repressor  32.93 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  31.4 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0432  heat-inducible transcription repressor  32.32 
 
 		 363 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  32.06 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  33.03 
 
 		 362 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.54 
 
 		 343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.36 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  32.63 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  33.23 
 
 		 362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  31.33 
 
 		 362 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  35.03 
 
 		 343 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  29.34 
 
 		 352 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  29.04 
 
 		 352 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2842  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.56 
 
 		 342 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.21 
 
 		 350 aa  129  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.1 
 
 		 343 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.54 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0326  heat-inducible transcription repressor  32.23 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0467  heat-inducible transcription repressor  32.83 
 
 		 370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.1 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.19 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0394  heat-inducible transcription repressor  33.23 
 
 		 362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  28.74 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.38 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  30.68 
 
 		 343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  29.75 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  32.52 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.41 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.57 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.41 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.8 
 
 		 337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  29.71 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.95 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 		 344 aa  126  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  29.62 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  31.69 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.91 
 
 		 344 aa  126  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  31.69 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  31.69 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3005  heat-inducible transcription repressor  31.4 
 
 		 359 aa  125  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.42 
 
 		 337 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  29.61 
 
 		 352 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  28.86 
 
 		 334 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2944  heat-inducible transcription repressor  30.79 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  30.97 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  28.62 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.49 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  28.62 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  28.88 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  29.45 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.95 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  28.62 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  28.62 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  28.62 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  28.62 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  28.62 
 
 		 340 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  31.82 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  30.75 
 
 		 338 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1266  heat-inducible transcription repressor  31.91 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0103094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  32.83 
 
 		 367 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1858  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.29 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  30.58 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.57 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2534  heat-inducible transcription repressor  31.31 
 
 		 366 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  29.45 
 
 		 339 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.83 
 
 		 346 aa  122  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1674  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.19 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.46 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1640  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.19 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.407829  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.6 
 
 		 344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.4 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.88 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.32 
 
 		 352 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  28.53 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.73 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  28.53 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  30.75 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  28.53 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  30.43 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>