247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1150 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 325 aa  657    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1674  heat-inducible transcription repressor HrcA  72 
 
 		 325 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1640  heat-inducible transcription repressor HrcA  72 
 
 		 325 aa  474  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.407829  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  31.86 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  32.74 
 
 		 344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.91 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  30.7 
 
 		 338 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  30.38 
 
 		 343 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  30.51 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  30.51 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  30.51 
 
 		 338 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  29.73 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.39 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  30.42 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  30.42 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  30.51 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  29.73 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  30.51 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.49 
 
 		 355 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.94 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  28.44 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.87 
 
 		 353 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.87 
 
 		 353 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  28.44 
 
 		 339 aa  146  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.59 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  30.86 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.41 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.43 
 
 		 345 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.12 
 
 		 343 aa  142  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.48 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.93 
 
 		 343 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.14 
 
 		 351 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  27.83 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.57 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.96 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.25 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  29.76 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.82 
 
 		 357 aa  136  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  27.54 
 
 		 343 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.46 
 
 		 344 aa  135  8e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  29.79 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  27.19 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  27.19 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  27.19 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  27.19 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  27.19 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.57 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  30.06 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  27.19 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  27.19 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  27.19 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.46 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.57 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  28.13 
 
 		 337 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.93 
 
 		 351 aa  132  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.22 
 
 		 345 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  30.59 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.6 
 
 		 339 aa  132  6.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  27.33 
 
 		 340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  28.53 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  26.59 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  26.59 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  26.59 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  26.59 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  26.59 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  26.59 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.79 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1168  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.83 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  27.76 
 
 		 339 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  28 
 
 		 351 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  30 
 
 		 334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  27.09 
 
 		 352 aa  129  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.83 
 
 		 337 aa  129  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.15 
 
 		 337 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  27.81 
 
 		 339 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  26.28 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  28.66 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.05 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  28.27 
 
 		 345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  28.18 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  28.74 
 
 		 352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.53 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  30 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.47 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  27.33 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  28.4 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  27.54 
 
 		 342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  28.45 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.85 
 
 		 351 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.24 
 
 		 348 aa  125  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  29.36 
 
 		 343 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  27.35 
 
 		 348 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  26.28 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  28.14 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.47 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  27.06 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  28.45 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  27.49 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  26.28 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  28.4 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>