244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1242 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1242  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 340 aa  687    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0655276  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0089  heat-inducible transcription repressor HrcA  50 
 
 		 337 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000627651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0076  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.07 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0076  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.77 
 
 		 338 aa  249  7e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666316  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1823  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.93 
 
 		 335 aa  149  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.36 
 
 		 351 aa  129  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.51 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.53 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.07 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.29 
 
 		 345 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.06 
 
 		 344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.11 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.3 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  27.03 
 
 		 338 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  26.74 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  26.74 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  26.74 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.66 
 
 		 347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  26.74 
 
 		 338 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  26.74 
 
 		 338 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  27.03 
 
 		 338 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  26.45 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  26.45 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  26.16 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  26.04 
 
 		 340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.63 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.03 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.08 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  26.43 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  26.99 
 
 		 348 aa  109  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.22 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.67 
 
 		 337 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.56 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  30.24 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.95 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.33 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.3 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.99 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.01 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.84 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.16 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.65 
 
 		 344 aa  106  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  25.87 
 
 		 344 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.92 
 
 		 340 aa  106  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  28.57 
 
 		 357 aa  105  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  27.06 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.49 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  25.21 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.01 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  25.96 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  30.37 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.65 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  30.29 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.6 
 
 		 341 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  29.24 
 
 		 337 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  26.09 
 
 		 364 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.9 
 
 		 376 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.29 
 
 		 346 aa  101  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.1 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  32.35 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.49 
 
 		 341 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.54 
 
 		 365 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.63 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  25.56 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.42 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.22 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  24.14 
 
 		 370 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.33 
 
 		 351 aa  99.8  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  25.07 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.44 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0763  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.27 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.94526  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  26.72 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.84 
 
 		 346 aa  97.4  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.49 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  28.5 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.31 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  23.51 
 
 		 336 aa  96.7  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.39 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.28 
 
 		 343 aa  96.7  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  29.32 
 
 		 367 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.93 
 
 		 343 aa  95.9  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.28 
 
 		 342 aa  95.9  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  32.26 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  30.05 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  26.07 
 
 		 354 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2534  heat-inducible transcription repressor  26.74 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.64 
 
 		 339 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1401  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.04 
 
 		 345 aa  94  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.99 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1210  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.33 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297014  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  29.32 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1183  heat-inducible transcription repressor  26.04 
 
 		 345 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556143  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.16 
 
 		 350 aa  93.2  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  26.86 
 
 		 343 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  27.76 
 
 		 343 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1266  heat-inducible transcription repressor  27.7 
 
 		 366 aa  93.2  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0103094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.36 
 
 		 343 aa  92.8  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  26.35 
 
 		 336 aa  92.8  8e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl417  heat inducible transcription repressor  39.87 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.51 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>