247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0089 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0089  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 337 aa  676    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000627651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1242  heat-inducible transcription repressor HrcA  50 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0655276  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0076  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.32 
 
 		 338 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0076  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.14 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666316  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1823  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.21 
 
 		 335 aa  156  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.88 
 
 		 351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.87 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.62 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.25 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  28.82 
 
 		 348 aa  122  9e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.98 
 
 		 341 aa  122  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.35 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.07 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  27.51 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.32 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.57 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.01 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.2 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.01 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.43 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.99 
 
 		 345 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  30.77 
 
 		 334 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.71 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.99 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  26.74 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  26.96 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  26.55 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.13 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.89 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  27.68 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  26.25 
 
 		 338 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.99 
 
 		 354 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  28.15 
 
 		 339 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.07 
 
 		 348 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.09 
 
 		 357 aa  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  26.67 
 
 		 338 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  26.67 
 
 		 338 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.14 
 
 		 357 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  28.37 
 
 		 342 aa  112  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  27.66 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  29.62 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  26.67 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  26.67 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  27.86 
 
 		 339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  26.38 
 
 		 338 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  26.63 
 
 		 339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.59 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  26.38 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  27.17 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.83 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  25.97 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  30.65 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.83 
 
 		 345 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  26.84 
 
 		 342 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  31.68 
 
 		 337 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.49 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  28.57 
 
 		 352 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  27.17 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  30.77 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  27.27 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  27.35 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  27.15 
 
 		 357 aa  106  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.65 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  25.07 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  29.46 
 
 		 334 aa  106  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.55 
 
 		 347 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.96 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.95 
 
 		 365 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.04 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.11 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  28.87 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.3 
 
 		 343 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.28 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  27.73 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.48 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  26.63 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  25.87 
 
 		 351 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1210  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.48 
 
 		 345 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297014  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  26.22 
 
 		 340 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.36 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.84 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.36 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  26.14 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  28.87 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  25.42 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  26.38 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  26.38 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.35 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.51 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1183  heat-inducible transcription repressor  24.56 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556143  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  26.38 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  26.38 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  26.38 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  26.38 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  25.64 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  26.38 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  22.88 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.51 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  28.52 
 
 		 365 aa  99.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_002936  DET1401  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.56 
 
 		 345 aa  99.4  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>