248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0076 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0076  heat-inducible transcription repressor HrcA  95.86 
 
 
338 aa  654    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0076  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
338 aa  674    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666316  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1242  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.77 
 
 
340 aa  249  7e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0655276  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0089  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.14 
 
 
337 aa  237  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000627651  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1823  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.63 
 
 
335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.79 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  30.42 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.07 
 
 
337 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.73 
 
 
345 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.84 
 
 
344 aa  122  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.07 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.51 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.83 
 
 
343 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  31.79 
 
 
364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.79 
 
 
346 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  27.63 
 
 
339 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  26.96 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  26.92 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.19 
 
 
343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  28.85 
 
 
370 aa  116  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.68 
 
 
343 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  28.25 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.6 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  26.69 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.88 
 
 
344 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  25.75 
 
 
344 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  29.41 
 
 
351 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.79 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.15 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.79 
 
 
352 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  28.26 
 
 
340 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  29.97 
 
 
343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  26.48 
 
 
338 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  26.79 
 
 
338 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  26.48 
 
 
338 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  27.81 
 
 
357 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  25.86 
 
 
338 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  26.48 
 
 
338 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.38 
 
 
337 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  26.48 
 
 
338 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  28.93 
 
 
341 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.18 
 
 
347 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  26.17 
 
 
338 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  27.03 
 
 
348 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  26.17 
 
 
338 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  27.16 
 
 
343 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  27.24 
 
 
343 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  29.03 
 
 
339 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  29.19 
 
 
339 aa  106  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.66 
 
 
340 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  26.17 
 
 
338 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  26.17 
 
 
338 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  29.74 
 
 
336 aa  106  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  28.16 
 
 
349 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.48 
 
 
348 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.85 
 
 
351 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.1 
 
 
339 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  27.69 
 
 
365 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.77 
 
 
340 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  29.12 
 
 
340 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.9 
 
 
355 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  25.22 
 
 
352 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  28.85 
 
 
360 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.01 
 
 
341 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.05 
 
 
351 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  26.18 
 
 
347 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  26.18 
 
 
347 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  26.18 
 
 
347 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.77 
 
 
351 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  34.38 
 
 
354 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  26.55 
 
 
339 aa  103  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.09 
 
 
350 aa  102  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.85 
 
 
348 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.83 
 
 
340 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.16 
 
 
343 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.79 
 
 
365 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1266  heat-inducible transcription repressor  28.73 
 
 
366 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0103094 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.33 
 
 
350 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.91 
 
 
336 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.71 
 
 
345 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.26 
 
 
347 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.06 
 
 
346 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.81 
 
 
354 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.39 
 
 
341 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.85 
 
 
340 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.45 
 
 
344 aa  99.4  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  27.24 
 
 
343 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.15 
 
 
350 aa  99  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.07 
 
 
357 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  29.04 
 
 
334 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  26.76 
 
 
337 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1693  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.73 
 
 
357 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.608682  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.22 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  29.31 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.63 
 
 
345 aa  97.4  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.05 
 
 
342 aa  97.1  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.3 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2873  heat-inducible transcription repressor  28.33 
 
 
354 aa  97.1  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.45 
 
 
376 aa  97.1  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  30.3 
 
 
367 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>